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根据GeneBank数据库中已知水稻抗病基因Lrr19类似物序列,设计引物,比较普通"生稻、粳稻和籼稻的基因序列,初步分析了3种水稻Lrr19类似物的序列差异,与小麦抗病基因Lrr19编码序列的同源性。结果发现在水稻不同品系间发生部分位点碱基的变化,相似性为97%~98%;水稻中该类似物编码的蛋白质与小麦的LRR19有较高的同源性(54%~55%(,籼稻、粳稻和普通"生稻编码蛋白都在相同的位置存在NB-ARC和LRR结构域,并且与小麦LRR19蛋白相似。推测水稻Lrr19基因类似物是抗性相关基因,并且在水稻不同品种间序列差异不大,相对较为保守。 相似文献
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为探索新型大环内酯类杀虫剂天维菌素对蚊虫防控的应用前景,进一步了解天维菌素对蚊虫的作用机制,本研究利用转录组测序技术研究埃及伊蚊幼虫参与药物代谢及靶标等生物学过程的基因。利用高通量测序获取给药前后埃及伊蚊的差异表达基因,进一步进行Gene Ontology(GO)及KEGG富集分析,并利用Real-time Quantitative PCR(rt-qPCR)验证目标基因表达情况。结果显示,与对照组相比,天维菌素处理后埃及伊蚊幼虫中有2 647个基因差异显著表达,其中上调基因有697个,下调表达的基因有1 950个。Gene Ontology分析显示,测序基因主要注释到细胞过程、代谢过程、膜、结合和催化活性等功能类。KEGG通路主要富集在药物代谢、免疫应答、生物合成以及消化与吸收等过程。选取GST-1,EST2等6个目标基因进行rt-qPCR验证,表达水平与测序结果一致。 相似文献