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1.
基于ITS2序列的12种苔藓植物亲缘关系分析 总被引：1，自引：0，他引：1
以尖叶薄鳞苔为外类群,利用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对12种苔藓植物的ITS2序列进行比对和分析,构建分子系统树.结果表明,12种苔藓植物的ITS2序列长度在432-493bp之间,排序后总长度为540 bp,其中变异位点305个,信息位点200个.12种苔藓植物的遗传距离在0.016～0.472之间,平均遗传距离为0.309.利用MP法建立的系统树显示,12种苔藓植物分为3组,其中7个丛藓科物种聚为一组,3个青藓科物种聚为一组,2种灰藓科植物聚为一组,序列分析结果与形态学分类结果一致,表明ITS2可用于苔藓植物的亲缘关系分析. 相似文献
2.
以密叶挺叶苔为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对10种苔藓植物的基因序列进行比对和分析,构建分子系统树。结果表明:10种苔藓植物的trnL-F序列长度在434～487 bp之间,排序后总长度为505 bp,其中变异位点127个,信息位点81个。遗传距离在0.007～0.207之间,平均遗传距离为0.122。利用MP法建立的系统树显示,10种苔藓植物可分为两组,其中4种丛藓科苔藓聚为一组,3种青藓科和3种灰藓科苔藓聚为一组。序列分析结果与形态学结果基本一致,表明trnL-F序列可用于苔藓植物的亲缘关系分析。 相似文献
3.
为探讨玫瑰香系葡萄种质资源间的遗传关系,利用iPBS标记对39个玫瑰香系葡萄品种进行遗传多样性分析,并构建其DNA指纹图谱。筛选出14个引物,对39个玫瑰香系葡萄品种进行PCR扩增,共获得152条带,其中,多态性条带132条,多态性比率为86.86%。各引物多态性信息含量(PIC)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)和Shannon's信息指数(I)的平均值分别为0.863 8、1.868 4、1.409 0、0.251 8和0.390 7。39个玫瑰香系葡萄品种间的遗传相似系数为0.526 3~0.940 8,变幅为0.413 5。上述结果表明:39个玫瑰香系葡萄品种间具有较丰富的遗传多样性。利用UPGMA构建39个玫瑰香系葡萄种质资源的聚类树状图,在遗传相似系数(GS)为0.72处可将39个玫瑰香系葡萄品种分为4组,其中欧亚种主要分布在第Ⅰ组,而欧美杂交种主要分布在第Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组。利用8个引物的16个多态性位点构建了39个玫瑰香系葡萄品种的DNA指纹图谱,该图谱可为玫瑰香系葡萄品种的鉴定提供科学依据。 相似文献
4.
[目的]概述DNA条形码在苔藓植物中的研究进展,为将该技术更广泛地用于苔藓植物研究提供参考。[方法]结合DNA条形码技术的发展及其在动、植物研究中的应用,概述了该技术在苔藓植物研究中的现状及研究进展,并呼吁建立专门的机构对苔藓植物进行系统的DNA条形码研究策略,加快苔藓植物的研究。[结果]DNA条形码技术已在动植物研究中得到了广泛的应用,在植物研究中尚未获得理想的被广泛认同的DNA条形码。但研究发现,各种候选片段为苔藓植物分子生物学的发展提供了便利的检测手段。随着该技术的逐步发展完善,其将会在苔藓植物的科学研究中发挥越来越大的作用。[结论]DNA条形码技术是近年来生物学研究的热点,该技术在生命科学、法医学、流行病学、医药及食品质量控制等领域均具有广泛的应用前景,其将极大地促进人类监测、了解以及利用生物多样性的能力。该研究为DNA条形码技术在苔藓植物研究中的应用提供了参考。 相似文献
5.
以小叶苔为外类群,利用ClustalX2.0和MEGA4.1软件对12种苔藓植物的rps4基因序列进行比对和分析,构建分子系统树.结果表明:叶绿体rps4序列长度变异范围为669～677 bp,排序后总长度为683 bp,其中变异位点200个,信息位点122个.遗传距离为0.008 ～0.202,平均遗传距离为0.122.利用UPGMA法建立的系统树显示,12种苔藓植物分为3组,其中6种丛藓科(Pottiaceae)植物聚为一组,3种青藓科(Brachytheciaceae)植物聚为一组,3种灰藓科(Hypnaceae)植物聚为另一组.序列分析结果与形态学结果一致,表明rps4序列可用于苔藓植物的亲缘关系分析. 相似文献
6.
SRAP分子标记及其应用 总被引：3，自引：0，他引：3
相关序列多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,具有简便、稳定、中等产率、高共显性、易于测序等优点.它利用独特的引物设计对ORFs进行扩增,正、反引物分别与外显子和内含子(或启动子)区域配对,因不同物种、不同个体的内含子、启动子与间隔区长度不等而产生多态性.SRAP-PCR扩增程序采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后35个循环为50℃.目前SRAP已在植物图谱构建、遗传多样性评价、基因定位和比较基因组学等方面成功应用. 相似文献
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苔藓植物SRAP反应体系的优化 总被引：1，自引：0，他引：1
以黄灰藓总DNA为材料,对影响SRAP-PCR反应的模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和TaqDNA聚合酶浓度等因素进行了优化,分析了各因素对SRAP-PCR扩增结果的影响。结果表明,在25μLSRAP-PCR反应体系中,最佳反应条件为:模板DNA40ng;Mg2+浓度2.0mmol/L;dNTP浓度0.2mmol/L;正反引物15pmol;TaqDNA聚合酶2.0U。在此条件下,引物组合Me5/em7对13种苔藓植物扩增的条带清晰、多态性好,表明此反应条件适合于苔藓植物的SRAP-PCR反应体系。 相似文献
8.
北方粳稻品种类群划分及亲缘关系的RAPD分析 总被引：1，自引：0，他引：1
鉴于国内粳稻的类群划分及亲缘关系还鲜有RAPD分析的相关研究报道,本研究利用RAPD分子标记技术对18个北方粳稻品种进行了分类和亲缘关系研究,从80个随机引物中筛选出了21个引物用于PCR反应,共在146个位点上扩增出条带,平均每个引物扩增的位点数为6.95个,多态性位点104个,多态性比率为71.23%,显示了较高的多态性。其中,有15个引物具有单一标记条带或特异缺失条带,共可鉴别10个品种。应用SPSS11.5分析软件对18种供试材料进行了聚类分析,实验结果显示：18种粳稻品种可明显分为3类,第Ⅰ类的10个粳稻品种有8个品种与系谱分析结果相符,第Ⅱ类和第Ⅲ类中的粳稻品种都分别具有血缘关系,与系谱分析结果基本吻合。综上所述,RAPD技术在北方粳稻品种类群划分及亲缘关系研究中的应用是可行的。但两者的分析结果也存在一定的差异,我们建议在实际工作中应将分子标记法和系谱法有机结合、相互印证,减少亲本选择的盲目性,提高育种工作的可预见性。 相似文献
9.
[目的]建立和优化适合于苔藓植物matK基因的PCR反应体系。[方法]以鳞叶藓为材料,利用改良CTAB法提取了基因组DNA,利用单因素试验分析了DNA模板、引物和2×Taq MasterMix的浓度对苔藓植物matK基因PCR反应的影响,对适合苔藓植物的matK基因PCR反应条件进行了优化。[结果]适合苔藓植物的matK基因PCR反应体系为10.0μl,其中含DNA模板0.5μl,正反引物各0.2μl,2×Taq MasterMix 5.6μl。[结论]为苔藓植物的分子系统学等研究奠定了基础。 相似文献
10.
[目的]研究藓类植物提取液对作物种子萌发的影响。[方法]用北地扭口藓、灰藓的配子体水提液分别培养5种作物种子,测量种子胚芽和胚根的生长量、鲜重及干重。[结果]灰藓和北地扭口藓的配子体水提液促进了小麦胚根干重的增加,分别为对照的1.88和2.08倍;促进了玉米胚根伸长,分别为对照的1.18和1.21倍;促进了花生胚根伸长,分别为对照的1.14和1.15倍;显著增加了大豆胚根的干重,分别为对照的2.51倍和2.52倍;促进了蚕豆胚根伸长,分别为对照的1.45和1.39倍。[结论]灰藓、北地扭口藓的配子体水提液对作物种子萌发均有不同程度的促进作用,对农作物的胚根促进作用显著,提高了种子的萌发质量。说明藓类配子体的主要次生代谢产物或内源激素具有生物活性。 相似文献