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运用矩阵相关检测及聚类分析比较相结合的方法，在对广西玉林普通野生稻居群进行遗传结构分析中，从260至60每降低20个等位变异进行梯度取样，研究了不同SSR等位变异相似系数矩阵与总等位变异相似系数矩阵之间的相关关系。结果表明：1）当等位变异数为200时，居群内个体间的遗传关系与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数高达99.5%，达到极显著标准；如果将等位变异数梯度降低到10，则所有4个群体分别在等位变异数为180、190、210和200时与总变异数为277时个体间遗传关系的相关系数达到99.5%。2）当等位变异数减少到60时，其相关系数也达到95.0%的显著相关。3）所有4个群体在其相似系数达到99.5%时的聚类图与总变异数为277时的聚类图基本一致，只有个别样品在聚类图中的位置略有变化，但其相似系数为95.0%时聚类图与总变异数为277时的聚类图差异非常明显。因此，在进行普通野生稻居群遗传结构分析时，选择均匀分布于基因组的SSR引物并得到200个左右的等位变异时就能精确地获得居群内个体间的遗传关系。由于水稻SSR引物在野生稻居群遗传结构分析中的平均等位基因数约为4，所以，50对引物即能反映居群内个体间的遗传关系。 相似文献
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原、异位保存普通野生稻种质资源的遗传多样性比较研究 总被引：18，自引：0，他引：18
为了明确我国异位保存的普通野生稻是否能够代表原居群遗传多样性的完整性，利用SSR（简单序列重复）方法对江西省东乡县庵家山和水桃树2个普通野生稻居群的原、异位群体进行了遗传多样性比较研究。结果表明，庵家山居群原、异位保存群体的遗传多样性指数分别为0.5000和0.3555,异位保存群体的遗传多样性只有原位保存群体的71.1%，并且异位保存材料在聚类图中聚集在一起，仅为原位保护材料聚类图中的一个分支；虽然水桃树居群原、异位群体的遗传多样性指数分别为0.4100和0.4577,相差较小，并且原、异位保存材料在聚类图中混合聚类，似乎异位保存群体能够代表原居群的遗传多样性，但异位保存的14份材料在聚类图中有6份相邻的材料聚集在一起，说明异位保存取样时没有考虑野生稻植株的空间分布，属于重复取样，重复取样的比率高达42.9%。将2个分布点原、异位材料合并进行遗传多样性研究，结果与庵家山分布点的研究结果基本一致。据此推测我国保存的普通野生稻资源所包含的遗传变异相对较少，重复频率较高。建议进行普通野生稻遗传资源的再收集，并对已保存的野生稻种质资源进行全面鉴定，剔出重复样品。 相似文献
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东乡普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)原位保存群体的遗传分化和保护策略研究 总被引：4，自引：0，他引：4
【目的】东乡野生稻是世界上分布最北的普通野生稻居群，研究其遗传分化不仅能够阐明居群的起源、演化规律，而且可为其保护提供理论依据。【方法】利用SSR（简单序列重复）分子标记对江西东乡普通野生稻仅存的2个原位保护居群进行了30个位点的遗传多样性分析和遗传分化研究。【结果】东乡野生稻2个居群内和居群间的遗传多样性指数分别为0.4120和0.0564，居群间遗传分化系数仅为0.1219，即87%以上的遗传变异存在于居群内。POPGENE聚类分析结果也显示，东乡野生稻的2个居群实际属于一个大群体，水桃树居群可看作庵家山居群的一个分支。利用同样方法对庵家山居群人为隔离的3个小群体进行的研究结果表明，虽然3个小群体间遗传分化系数也很低（0.0975），仍然属于同一居群，但人工隔离引起的小生境变化已使得3个群体发生了遗传分化。【结论】在建立东乡野生稻原生境保护点时，一方面，应以有效保护庵家山居群为重点，另一方面，对庵家山居群的保护应充分考虑原居群的生态环境，拆除原有围墙，进行生态恢复。 相似文献
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