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[目的]黄芪作为药食两用的一味中药,其主要活性成包含皂苷,黄酮,多糖等。本文主要探究黄芪的近缘物种,同时挖掘黄芪活性成分皂苷类和黄酮类合成的关键基因并探究这些关键基因在不同年限的表达变化情况。[方法]本研究通过高通量转录组学技术对黄芪进行研究。首先利用Trinity对黄芪样本的转录组数据进行拼接以及unigenes鉴定,然后与物种库进行比对并构建系统发育进化树,明确黄芪的近缘物种。通过RSEM对unigenes进行表达定量,并利用KEGG和GSEA分析对基因表达谱进行基因功能注释找到黄芪中与皂苷类和黄酮类化合物合成的关键基因,最后通过RT-qPCR对相关的关键基因进行验证,进而明确皂苷类和黄酮类化合物合成关键基因在黄芪不同生长年限的表达情况。[结果]黄芪的近缘物种是鹰嘴豆。GSEA分析得到黄芪中皂苷类合成的关键基因为Unigene0003373和Unigene0040532,黄酮类合成的关键基因为Unigene0076081和Unigene0027187,且这4个基因的表达量在四年生黄芪里显著高于1年生黄芪。[结论]Unigene0003373、Unigene0040532、Unige... 相似文献
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禽腺病毒血清4型(FAdV-4)引起的禽肝炎-心包积液综合征已严重危害我国养禽业的发展,迫切需要深入了解FAdV-4的致病机制并制定有效的防控方案。论文旨在利用高通量测序技术分析禽腺病毒血清4型感染鸡肝癌(Leghorn male hepatocellular, LMH)细胞后差异表达的mRNA,以探究mRNA在FAdV-4感染过程中的作用及其调控机制。结果显示,与对照组相比,FAdV-4感染48 h共筛选到2 604个上调的差异表达基因,2 883个下调的差异表达基因。其中,GNB3、NECTIN4、SFRP4、FABP2、PLPP3、GALR1L和MBL2等基因之前并没有被报道过与FAdV-4感染相关。通过GO和KEGG分析得知,差异表达基因主要富集在从细胞表面位点和信号受体结合至细胞周期调节、MAPK信号通路、细胞黏附分子作用等;其中,显著下调的差异基因还富集到多种代谢途径中,提示病毒感染会影响宿主细胞的代谢水平。本研究为深入解析FAdV-4感染宿主细胞的致病机制提供了相关的理论基础及科学依据。 相似文献
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