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本研究旨在利用高通量测序技术比较不同生长速率肉鸡盲肠真菌结构差异,以探讨肉鸡生长速率与肠道真菌结构的关系。选择一商业化养殖鸡舍,开展10 000只肉仔鸡的饲养试验。38日龄时,随机选择600只公鸡进行称重,从中分别选取最高体重(H组)、中等体重(M组)和最低体重(L组)各8羽,取盲肠内容物用于高通量测序分析。Alpha多样性指数表明,L组真菌的丰度最高,其次为M组和H组;H组的真菌多样性最高,其次为M组和L组。真菌序列聚集成2 759个OTUs,分为5个菌门:球囊菌门(Glomeromycota),壶菌门(Chytridiomycota),接合菌门(Zygomycota),担子菌门(Basidiomycota)和子囊菌门(Ascomycota),优势菌门均为子囊菌门。丰度最高的10个属分别为念球菌属(Candida),隐球菌属(Cryptococcus),曲霉属(Aspergillus),哈萨克斯坦酵母(Kazachstania),刺盘孢属(Colletotrichum),赤霉菌属(Gibberella),微囊菌属(Microascus),Phialemoniopsis,链格孢属(Alternaria)和木霉属(Trichoderma),在属水平上肠道真菌存在较大的个体差异。L组与H组肉鸡肠道真菌群落构成差异较大,由聚类分析可知,L组致病菌曲霉菌属(Aspergillus)、毛霉菌(Mucor)丰度较高。 相似文献
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旨在阐明污染小麦的真菌的结构组成并分析污染小麦的真菌与麦粒中呕吐毒素(DON)浓度之间的关系。采用高效液相色谱法(HPLC)测定麦粒中的DON含量,选取DON浓度为高、中、低[DON含量分别为(2 982±1 534)、(972±251)、(42±1)μg/kg]的小麦样品各12份,抽提3组小麦微生物DNA进行真菌测序。结果表明,通过基因组DNA提取、高通量测序、生物信息学分析后,共得到820个运算分类单元(operational taxonomic unit,简称OTU)。基于不同分类水平的分析可知,其优势菌门为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota),平均相对丰度分别为46.964 0%、0.722 1%;优势菌属为链格孢属(Alternaria)、附球菌属(Epicoccum),分别占16.987 9%、5.570 1%。3组小麦中的真菌物种数量有显著差异(P0.05)。由研究结果可知,小麦中存在一定的病原真菌污染,如链格孢属(Alternaria)、葡萄孢属(Botrytis),有必要对携带真菌毒素DON小麦中的真菌结构进行检测,并分析两者间的关系。 相似文献
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