四球茶转录组SSR位点信息分析     

黎瑞源  邢辉  申铁 《安徽农业大学学报》2017,44(4):558-562

对基于高通量测序拼接获得的99 741条四球茶嫩叶Unigenes进行了SSR(simple sequence repeats)位点分析,共揭示了23 732个SSR位点,分布于18 552条Unigenes中,SSR发生频率为23.79%;含有SSR位点的Unigenes的总长度为226 188 bp,SSR位点间的平均距离为1/2.07 kb,重复长度平均长度为9.53 bp。在四球茶转录组SSR中,二核苷酸重复和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占总SSRs的47.53%和25.92%;在181种重复基元类型中,优势重复基元分别是AG/CT、A/T、ACC/GGT,分别占总SSRs的41.38%、22.10%和6.49%,共占总SSRs的比例达69.97%。  相似文献   

大肠杆菌菌体氨基酸组成对高渗透环境的响应     

申铁  杨琦  郭玉双  乙引  文汉  芮斌 《江西农业学报》2012,24(12):140-143

在正常和高渗透压(高盐)环境下培养大肠杆菌,利用气相色谱质谱联用仪(GC-MS)对大肠杆菌代谢物中的氨基酸进行了定性定量分析。结果表明:在两组中均鉴定出14种氨基酸,且两组的氨基酸种类相同;与对照组中同种氨基酸的相对含量相比,实验组中脯氨酸和甲硫氨酸的相对含量明显降低,丝氨酸、苏氨酸、苯丙氨酸、天冬氨酸、鸟氨酸、赖氨酸和组氨酸的相对含量明显增加,而丙氨酸、甘氨酸、缬氨酸、亮氨酸、谷氨酸的相对含量与对照组相近。  相似文献