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生长素(IAA)是一种重要的植物内源激素,YUCCA基因作为IAA生物合成的限速酶编码基因,在植物生长发育过程中起着重要的调控作用。为深入研究大白菜YUCCA基因家族的功能,利用生物信息学分析对大白菜中YUCCA基因家族成员进行全基因组水平鉴定,并对其基因组信息、蛋白质生理生化特征、基因结构、保守结构域、系统进化树等方面进行研究。结果表明,在大白菜基因组中共鉴定出19个YUCCA基因,可以聚类到2个大的分支,CladeⅠ和CladeⅡ;YUCCA基因在大白菜10条染色体上呈不均匀分布,并有1对基因以串联重复现象在染色体上分布;基因结构分析表明大白菜YUCCA基因一般含有0~3个数量不等的内含子;对大白菜YUCCA蛋白质氨基酸序列多重比对的分析表明大白菜YUCCA蛋白质存在高度保守的FAD结合位点(一致序列为GAGPxG)和NADPH结合位点(一致序列为GxGNSG);通过MEME软件对大白菜YUCCA蛋白质模体(motif)的预测还发现12个比较保守的motif。上述研究结果为大白菜YUCCA基因功能的研究奠定了一定的基础。 相似文献
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LHR基因在济宁青山羊发情周期不同阶段子宫中表达差异的研究 总被引:2,自引:1,他引:1
从济宁青山羊子宫组织中提取总RNA,用RT-PCR方法扩增黄体生成素受体(LHR)基因,获得一条286bp的片段,以pGEM-TEasy vector为载体,转染大肠杆菌E.coliDH5α,筛选阳性克隆并测序。采用优化的半定量RT-PCR技术,以山羊GAPDH为分子内参,比较研究了发情周期不同阶段的济宁青山羊子宫组织中LHR基因的表达差异。结果表明:得到的片段为山羊LHR基因的部分序列,与GenBank中登录的山羊LHR基因(AF379199)41-326 bp序列同源性高达100%。LHRmRNA在整个发情周期的子宫中都有表达。其中,发情期的表达水平最低(0.454±0.06),且与其它时期比较均差异显著(P〈0.05),随之在间情期升至最高值(0.705±0.09),尔后在发情前期降至(0.553±0.07)。这一研究结果为山羊的生殖内分泌调控机制研究提供了分子水平的数据。 相似文献
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猪腹泻病是一类冬春季常见的多因素疾病。无论是现代化规模的养殖场,还是中、小养殖专业户,或散养户均有发生。在猪的疾病中.腹泻病的发病率高达35%-45%。为了让专业人士更全面地了解该病、防制该病,特组织本专题。 相似文献
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以济宁地区主要农产品为研究对象,分析了农产品中Pb、Cd、Hg、As等重金属的污染情况并进行了评价,检测结果表明,济宁地区主要农产品中Pb、Cd、Hg、As重金属含量平均值均未超标;影响济宁地区农产品质量安全的重金属主要为Pb、As;受重金属污染的主要为大米、叶菜类蔬菜、根茎类蔬菜。 相似文献
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山羊子宫中LHR基因片段的克隆及半定量RT—PCR检测方法的建立 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】进一步研究处于发情周期不同阶段的济宁青山羊子宫中黄体生成素受体(LHR)mRNA表达量的变化,为探讨其对山羊生殖内分泌机制的作用规律提供理论依据。【方法】以GAPDH为内参照基因,从济宁青山羊的子宫组织中提取总RNA,用RT-PCR方法扩增目的基因,进行克隆测序,并对半定量RT-PCR反应体系进行了优化。【结果】获得了济宁青山羊LHR mRNA的部分序列,长度约为286 bp,与已报道的GenBank中羊的LHRmRNA(序列号为AF379199)41~326 bp序列同源性为100%。以此基因片段的阳性克隆为基础优化的半定量RT-PCR体系为:LHR基因的适宜循环数为30个,内参照GAPDH基因的循环数为26个,Mg2+浓度均为1.5 mmol/L。【结论】克隆了山羊LHR mRNA的部分序列,并建立了优化的半定量RT-PCR体系。 相似文献