玉米EST序列中微卫星的频率和分布^*     

赵美琼  宋燕  范静华  纪韵祚  罗琼  朱有勇  李成云 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(5):585-589

 利用Tandem Repeats Finder程序,以大于15 bp,匹配值为80%的标准,对已经公布的 1 162 745 条玉米EST序列中的SSR进行查找,共发现一至六核苷酸重复的SSR序列84 314个,占1 162 745个EST序列的7.25％。组成这些SSR的主要基序有A, C, AG, GGC, AGG, AAC, AAGT, AAAT, ACAT, AGAT, AGGT, AGAGG, AAAAG, AGGGG, AAAGC, GCCGAG, CGGCGT, CGCCGG, GCGGCA和CGCTGC,且以单核苷酸重复的SSR数量最多,为75 917个,其次是六核苷酸重复,为2 903个,这两类重复的SSR占总数的93.48%,四、五核苷酸重复的SSR数量较少,分别为772和779个。值得注意的是,所有这些在玉米EST中发现的SSR序列的碱基数都大于24 bp。这暗示利用这些SSR序列有可能开发出一批扩增效果好,多态性高的SSR分子标记,有助于玉米高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究。  相似文献   

热带·亚热带高产高抗玉米新品种金玉98的选育及高产栽培技术     

纪骏炜  傅敬东  黄金虹  傅杨  纪韵祚 《安徽农业科学》2012,40(3):1382+1386

金玉98是昆明市耕源玉米育种有限公司于2007年选育出的高产、高抗玉米杂交新组合.从选育经过、产量表现、农艺性状、生育期、抗性等方面阐述了金玉98的特征特性,并总结了其高产栽培技术要点和制种技术要点.  相似文献   

玉米EST序列中微卫星的频率和分布   总被引：3，自引：0，他引：3  

赵美琼  宋燕  范静华  纪韵祚  罗琼  朱有勇  李成云 《云南农业大学学报(自然科学版)》2008,23(5)

利用Tandem Repeats Finder程序,以大于15 bp,匹配值为80%的标准,对已经公布的1 162 745条玉米EST序列中的SSR进行查找,共发现一至六核苷酸重复的SSR序列84 314个,占1 162 745个EST序列的7.25%.组成这些SSR的主要基序有A,C,AG,GGC,AGG,AAC,AAGT,AAAT,ACAT,AGAT,AGGT,AGAGG,AAAAG,AGGGG,AAAGC,GCCGAG,CGGCGT,CGCCGG,GCGGCA和CGCTGC,且以单核苷酸重复的SSR数量最多,为75 917个,其次是六核苷酸重复,为2 903个,这两类重复的SSR占总数的93.48%,四、五核苷酸重复的SSR数量较少,分别为772和779个.值得注意的是,所有这些在玉米EST中发现的SSR序列的碱基数都大于24 hp.这暗示利用这些SSR序列有可能开发出一批扩增效果好,多态性高的SSR分子标记,有助于玉米高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究.  相似文献