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[目的]为了对荔枝果皮中克隆的APX基因进行cDNA序列分析。[方法]采用RT-PCR和RACE技术从荔枝果皮中扩增克隆抗坏血酸过氧化物酶基因,利用NCBI的ORFFinder程序分析克隆基因的序列,然后将ORF转换成氨基酸序列,进行BLASTX和BLASTN分析,最后用dnasismax2.6pro软件将荔枝与胡瓜、加杨等8种植物进行APX氨基酸序列配比和进化树分析。[结果]该基因cDNA全长1118bp,含有645bp的ORF,编码214个氨基酸。它编码的氨基酸序列与胡瓜、加杨、龙眼、落花生、豌豆、芸苔、帕拉港橡胶树和紫花苜蓿编码的氨基酸序列的同源性分别为83%、89%、97%、78%、84%、75%、79%和85%。推测该蛋白的分子式为C1946H3249N645O827S142,相对分子质量为53466.5,等电点为5.16,理论推导半衰期大于10h。[结论]该基因的克隆与cDNA序列分析为采后荔枝果皮中抗坏血酸过氧化物酶的基因工程操作奠定了基础。 相似文献
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改良CTAB法从采后荔枝(Litchi chinensis Sonn.)果皮中提取总RNA 总被引:13,自引:0,他引:13
成熟荔枝果实的果皮中多酚、花色素苷、多糖、蛋白质等物质含量较高。内源RNAase活性也上升,使得从中提取高质量RNA较为困难。丁晓东0999)、张以顺等(2004)曾分别探索了从荔枝果实组织中提取总RNA的方法。但用这些方法都不能从荔枝果皮中得到高产率或高质量的总RNA。在综合比较多种方法的基础上。本实验对CTAB法(山蓝等,2002)作了改良.成功地从采后荔枝果皮中提取了可用于反转录的RNA。 相似文献
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