簇毛麦基因组特异DNA序列标记的建立和应用   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

迟世华  杨足君  冯娟  周建平  刘成  任正隆 《麦类作物学报》2006,26(4):1-5

为建立簇毛麦基因组特异DNA序列的分子标记，以普通小麦中国春、绵阳11、川农17和R111以及多年生簇毛麦、硬粒小麦一多年生簇毛麦双二倍体TDB-3为材料，用120条随机引物进行RAPD分析，筛选出一个多年生簇毛麦的特异性RAPD片段。克隆测序表明该片段全长为937bp（记为OPM2 937）。以OPM2 937的DNA序列为基础设计了一对特异引物，并用该特异引物对多年生簇毛麦、二倍体簇毛麦以及中国春-二倍体簇毛麦附加系CSDA1V～CSDA7V与小麦-多年生簇毛麦衍生后代进行了扩增，结果表明，凡具有簇毛麦染色体的材料均可扩增出目标DNA片段，而不具簇毛麦染色体的材料均未能得到扩增。将OPM29 937在NCBI中进行序列比对，发现它是一个新的序列，说明OPM2 937为簇毛麦基因组的一个特异序列，该DNA序列标记可用于快速跟踪检测小麦背景中的簇毛麦染色体。  相似文献   

黑麦染色体组中一个新重复序列的发现、定位与应用     

刘成  杨足君  冯娟  迟世华  周建平  任正隆 《中国农业科学》2007,40(8):1587-1593

 【目的】寻找黑麦基因组中新的重复序列作为特异PCR标记。【方法】以普通小麦中国春、川农18、育成品系R111、绵阳11为对照，以荆州黑麦、秦岭黑麦、非洲黑麦、森林黑麦为材料，用RAPD法筛选到黑麦基因组中的一个高拷贝DNA片段OPD15940，将OPD15940输入到NCBI的BLAST框中进行比对。根据OPD15940设计特异PCR引物D15F和D15R，利用这对引物对小麦族物种进行扩增，验证OPD15940的特异性。进而利用原位杂交技术定位pScD15940在染色体上的位置。【结果】序列比对后发现OPD15940与重复序列Sukkula中近60个53bp的小片段有较高的同源性，但又不同于Sukkula，是一类新的重复序列。通过特异PCR确定仅含黑麦染色质的物种能扩增出OPD15940，因而OPD15940为黑麦所特有。原位杂交结果显示除端部区域外，pScD15940弥散状分布在黑麦整套染色体上。【结论】OPD15940可以作为分子标记检测导入到小麦背景中的黑麦染色体。  相似文献