甘蔗花叶病毒南城分离物外壳蛋白基因序列测定及分析     

蒋军喜  钱亚娟  谢艳  阙海勇  罗有强  向妙莲 《江西农业大学学报》2008,30(3):464-467

从江西南城甘蔗病株中获得1个甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)分离物,命名为SCMV-NCH。根据SCMV外壳蛋白(CP)基因N-端和C-端保守序列设计引物,对SCMV-NCH的CP基因进行RT-PCR扩增、克隆和测序,获得924个核苷酸(nt),推断编码308个氨基酸(aa)的近全长CP基因序列。与SCMV亚组SCMV、高粱花叶病毒(SrMV)、玉米矮花叶病毒(MDMV)、约翰逊草花叶病毒(JGMV)、玉米花叶病毒(ZeMV)、白草花叶病毒(PenMV)等6种病毒代表性株系外壳蛋白氨基酸序列同源性比较结果显示,SCMV-NCH与SCMV的同源性最高(86.2%),与其他5种病毒同源性相对较低(56.4%~72.2%)。与SCMV13个分离物外壳蛋白氨基酸序列进行同源性比较并构建关系树,结果显示SCMV-NCH与我国浙江2个分离物(Yuhang和Xiaosh)具有最近的亲缘发生关系。  相似文献   

用滚环扩增技术检测双生病毒   总被引：2，自引：0，他引：2  

余玲玲  钱亚娟  周雪平 《植物病理学报》2008,38(6):570-575

 本文报道了利用滚环扩增技术(rolling circle amplification,RCA)放大双生病毒的靶核酸信号,进而利用限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)检测不同类型双生病毒的新技术体系。研究结果表明,利用RCA-RFLP对于已知的单组份和双组份以及带有卫星的菜豆金色花叶病毒属病毒都能够有效检测,对采自浙江杭州地区的田间样品进行RCA-RFLP检测的结果与利用简并引物PA和PB进行PCR扩增的结果相吻合。相比传统的PCR检测方法,用RCA-RFLP体系检测双生病毒灵敏性更高,操作更简便。  相似文献   

利用小RNA深度测序和组装技术鉴定紫藤花叶病病原     

苏秀  徐毅  陈莎  傅帅  钱亚娟  张立钦  周雪平 《植物病理学报》2015,45(1):88-92

<正>RNA沉默(RNA silencing)是一种在真核生物体内普遍保守的基于核酸序列特异性抑制基因表达的调控机制[1]。2009年Kreuze等[2]发现病毒特异的小RNA(small RNA,sRNA)在序列上是重叠的,因此推测通过深度测序技术获得的大量sRNA序列能用来组装病毒的基因组并用来鉴定和发现新病毒。利用sRNA深度测序技术已在作物和昆虫上鉴定发现多种病毒[3、4],但在木本植物上还未见报道。  相似文献