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旨在克隆合作猪干扰素ε(Interferon epsilon,IFN-ε)基因,并对其结构和编码蛋白进行生物信息学分析,为进一步研究合作猪IFN-ε生物学功能提供参考。根据GenBank上公布的猪IFN-ε基因序列(登录号:NM_001105310.1)设计引物,PCR扩增及测序获得合作猪IFN-ε基因完整编码区序列(Coding sequence,CDS),并对其进行生物信息学分析。结果显示,合作猪IFN-ε基因编码区长582bp,编码193个氨基酸。该基因编码区序列与杜洛克猪、人、小鼠、黑猩猩、狗、瘤牛、蒙古野马、山羊和绵羊的同源性分别为98.4%、77.7%、56.8%、78.2%、76.5%、87.0%、85.5%、85.0%和86.0%;系统进化树结果表明,合作猪与瘤牛、蒙古野马、绵羊、山羊亲缘关系较近。此外,在合作猪IFN-ε基因CDS上共发现3个碱基突变,均为错义突变。氨基酸序列分析表明,合作猪IFN-ε蛋白分子式为C_(1027)H_(1630)N_(278)O_(290)S_(10),理论分子质量为22.83ku,等电点(pI)为8.43,属于碱性蛋白;平均亲水系数为-0.240,属于亲水蛋白质;IFN-ε蛋白无跨膜结构,存在信号肽序列,属于分泌型蛋白;IFN-ε蛋白只包含1个超家族保守结构域,即IFab结构域。二级结构分析表明,该蛋白中α-螺旋、无规则卷曲、β-转角和延伸链所占比例分别为61.66%、30.05%、3.11%和5.18%。 相似文献
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本试验旨在探讨饲粮中用花椒籽部分代替玉米对育肥猪的生长性能、肉品质、背最长肌脂肪酸组成的影响。选择90日龄、体重为33 kg的健康杜×长×大三元猪288头,随机分为4组,每组4个重复,每个重复18头。对照组饲喂基础日粮,试验组分别用花椒籽代替饲粮中2.5%、5%、7.5%的玉米,预试验7d,正试期100 d。结果表明:5%花椒籽组平均日增重(ADG)和耗料增重比(F/G)最高,7.5%花椒籽组ADG最低;各组间pH45min、肉色无显著差异;各试验组熟肉率、pH24h显著低于对照组,而试验组间熟肉率、pH24h差异不显著;各试验组的肌肉失水率较对照组显著上升,各试验组间失水率差异不显著;背最长肌中n-3PUFAs、α-亚麻酸(ALA)含量随花椒籽添加量上升而上升,7.5%花椒籽组n-3PUFAs、ALA均极显著高于对照组;n-6/n-3随花椒籽添加量的上升而下降;各试验组DHA、EPA含量显著高于对照组,试验组间差异不显著。可见,用2.5%~5%花椒籽代替玉米可提高育肥猪的生长性能,提高猪背最长肌中的n-3PUFAs含量,降低n-6/n-3,不会对肉品质产生不良影响。 相似文献
3.
基于Illumina Hiseq 4000高通量测序技术筛选得到仔猪感染C型产气荚膜梭菌耐受和易感组中显著上调表达的miR-204。为研究miR-204在各组织中的表达,进一步筛选miR-204参与调控仔猪C型产气荚膜梭菌感染的关键靶基因,采用实时荧光定量PCR方法检测了miR-204在7日龄仔猪各组织中的表达,利用MEGA7.0软件对其成熟体序列保守性进行分析,运用TargetScan、miRDB、PicTar软件进行靶基因预测,并用DAVID软件对靶基因进行Gene Ontology和KEGG Pathway通路富集分析,进一步采用qRT-PCR方法对筛选得到的关键靶基因在猪肠上皮细胞(IPEC-J2)中进行靶向关系验证。结果表明,miR-204在7日龄仔猪肾脏、肝脏、胸腺、淋巴、十二指肠和回肠组织中均高度表达,其成熟体序列在脊椎动物间高度保守。3种软件预测到的共同靶基因有114个,这些靶基因显著(P<0.05)富集在15个GO功能和13个信号通路。结合前期得到的抗性基因,筛选到4个关键靶基因NR3C1、SIRT1、BCL2L2和DLG5,转染miR-204 mimics后,靶基因SIRT1、BCL2L2和DLG5极显著(P<0.01)下调表达。miR-204是参与调控仔猪抵抗C型产气荚膜梭菌感染的重要因子,SIRT1、BCL2L2和DLG5可能是miR-204的关键靶基因,其功能还需进一步验证。 相似文献
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【目的】探索复方中药制剂防治仔猪腹泻效果及其对母猪繁殖性能和年生产力的影响.【方法】选取40头腹泻仔猪,随机分成2组,试验组注射复方中药制剂,对照组不作处理,分析腹泻治疗效果;选取60头健康仔猪,随机分成2组,试验组仔猪分别于出生2 h内、4日龄、10日龄注射复方中药制剂,对照组不作处理,分析腹泻预防效果;选取16头品种、胎次均相同的产后母猪(产仔数无差异)及其对应的哺乳仔猪(初生质量差异不显著),随机分成2组,试验组母猪产后注射复方中药制剂,对照组不作处理,测定其断奶仔猪数、21日龄个体质量、21日龄窝质量及断奶母猪再发情时间等指标,比较两者之间的繁殖性能、年生产力及每头母猪年提供断奶仔猪带来的经济效益.【结果】在治疗腹泻仔猪试验中,试验组的腹泻率和腹泻指数均极显著低于对照组(P0.01);在预防仔猪腹泻试验中,试验组的腹泻率极显著低于对照组(P0.01),腹泻指数显著低于对照组(P0.05);在母猪繁殖性能方面,试验组母猪21日龄窝质量极显著高于对照组(P0.01),断奶仔猪存活头数显著高于对照组(P0.05),仔猪腹泻率显著低于对照组(P0.05),断奶至再发情时间极显著低于对照组(P0.01),每头试验组母猪和对照组母猪年提供断奶仔猪数分别为17.60头和14.17头,根据当前市场价格纯盈利分别为5 249.32元和3 130.3元.【结论】说明中药制剂对哺乳仔猪腹泻的防治具有明显效果,可提高母猪繁殖性能和年生产力,经济效益显著. 相似文献
5.
【目的】探索猪新品系-HN的繁殖性能及年生产力.【方法】研究以60头‘大白母猪’2～4胎繁殖性能为对照,对45头新品系-HN母猪2～4胎窝总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数、仔猪育成率、初生个体质量、初生窝质量、21日龄个体质量、21日龄窝质量、断奶个体质量、断奶窝质量和乳头数等指标进行测定,比较分析了两者之间的繁殖性能、年生产力及每头母猪年提供断奶仔猪带来的经济效益.【结果】新品系-HN猪总产仔数(14.81头)、产活仔数(14.14头)、断奶存活仔数(13.28头)、初生窝质量(16.88 kg)、断奶窝质量(81.03 kg)和乳头数(7.98对)都极显著高于‘大白猪’(P0.01);初生个体质量(1.19 kg)、21日龄个体质量(4.00 kg)和断奶个体质量(6.10 kg)都极显著低于‘大白猪’(P0.01);21日龄窝质量(53.36 kg)显著高于‘大白猪’(P0.05);仔猪育成率为93.92%,高出‘大白猪’11.78%;每头新品系-HN猪和‘大白猪’母猪年提供断奶仔猪数分别为27.90头和17.31头,根据当前市场价格纯盈利分别达6 524.95元和3 940.43元.【结论】新品系-HN猪产仔性能、泌乳性能、成活率、年生产力和每头母猪年提供断奶仔猪数带来的经济效益都优于‘大白猪’. 相似文献
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【目的】对高繁殖力猪新品系HN进行遗传评定.【方法】采用多性状动物模型BLUP法(最佳线性无偏预测法)和REML法(非求导约束最大似然法)对高繁殖力猪新品系HN繁殖性状的表型参数和遗传参数进行了估测.【结果】高繁殖力猪新品系HN繁殖性状的变异系数较小,在1.75%~6.42%之间;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数、有效乳头数、初生个体质量、初生窝质量、21日龄个体质量、21日龄窝质量、断奶个体质量和断奶窝质量的遗传力分别为0.160、0.091、0.112、0.072、0.167、0.170、0.116、0.119、0.202和0.114;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数与初生个体质量、21日龄个体质量、断奶个体质量的表性相关(-0.220、-0.121、-0.061、-0.249、-0.125、-0.099、-0.179、-0.057、-0.217)呈弱的负相关,其他繁殖性状间的表型相关和遗传相关都呈正相关,且断奶窝质量与其他繁殖性状间的表型相关和遗传相关均呈中等或强的正相关;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数、有效乳头数、初生个体质量、初生窝质量、21日龄个体质量、21日龄窝质量、断奶个体质量和断奶窝质量的世代遗传进展分别为0.000 440头/世代、0.001 019头世代、0.000 112头/世代、0.003 106对/世代、0.004 361kg/世代、0.000 115 kg/世代、0.002 620 kg/世代0.010 261 kg/世代、0.001 875 kg/世代和0.011 226kg/世代.【结论】各性状的表型参数变异系数较小,繁殖性状的遗传力符合一般规律,说明高繁殖力猪新品系HN已具有稳定的遗传基础,已达到选育的目标;在选育过程中,可以把总产仔数和断奶窝质量作为主选性状,用于选择高繁殖力个体. 相似文献
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circRNAs在病原菌感染宿主的肠道疾病发展中具有重要的调控作用。C型产气荚膜梭菌（C.perfringens type C）是引起仔猪腹泻及相关肠道炎症的主要细菌之一,对产业造成了严重的经济损失。然而,目前有关circRNAs如何调控仔猪C型产气荚膜梭菌性腹泻的全面且系统的研究未见报道。本研究通过RNA高通量测序研究分析了C型产气荚膜梭菌感染的7日龄仔猪回肠组织circRNAs的表达谱,筛选差异表达circRNAs,并进行差异表达基因GO和KEGG功能富集分析,利用miRanda等软件预测circRNA的microRNA靶点,构建circRNA-miRNA-mRNA的互作网络,并进行qPCR验证。结果显示,在C型产气荚膜梭菌感染的处理组（TI组）和对照组（CI组）中共鉴定出3 162个circRNAs,其中差异表达circRNAs有694个,上调表达circRNAs有404个,下调表达circRNAs有290个。功能富集分析结果表明,差异表达circRNAs的亲本基因主要富集在细胞周期、TGF-β信号通路、赖氨酸降解、Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、MAPK信号通路等,调节仔猪对产气荚膜梭菌感染的抗性反应。此外,本研究构建了与C型产气荚膜梭菌感染致仔猪腹泻相关的circRNA-miRNA-mRNA互作网络,发现8 circRNAs-5 miRNAs-12 mRNAs组成的ceRNA网络与产气荚膜梭菌感染性疾病密切相关。本试验可为深入研究circRNA调控仔猪C型产气荚膜梭菌性腹泻疾病及猪抗腹泻病品系培育提供参考。 相似文献
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杜仲叶对育肥猪生长性能、胴体性状、抗氧化能力及肠道菌群的影响 总被引：2，自引：0，他引：2
本试验旨在研究饲粮中添加杜仲叶对育肥猪生长性能、胴体性状、抗氧化能力及肠道菌群的影响,探讨其在育肥猪上的应用效果。选择出生日龄相近、健康状况良好且体重[(27±1)kg]无显著差异(P0.05)的长白×大白猪60头,随机分为3组,每组20头猪。其中对照组饲喂基础饲粮(不添加任何抗生素),试验组分别用3%、4%杜仲叶粉替代基础饲粮中同比例次粉,试验期共102 d,试验结束时,每组随机选取4头猪(公母各占1/2)屠宰,测定胴体性状及肉品质指标。结果表明:试验第1~52天,与对照组相比,4%杜仲叶添加组平均日增重显著提高(P0.05),腹泻率极显著降低(P0.01);试验第53~102天,与对照组相比,试验组料重比极显著下降(P0.01)。与对照组相比,试验组眼肌面积增加(P0.05),滴水损失极显著下降(P0.01),肝脏中谷胱甘肽过氧化物酶活性显著或极显著上升(P0.05或P0.01),肝脏中丙二醛含量极显著降低(P0.01)。4%杜仲叶添加组大肠杆菌和沙门氏菌数量显著低于对照组(P0.05),双歧杆菌与乳酸菌数量差异不显著(P0.05)。结果提示:饲粮添加4%杜仲叶可显著降低育肥猪的腹泻率,提高育肥猪生长性能,改善其胴体性状和肉品质,提高肝脏抗氧化能力,对肠道菌群数量具有一定的调控作用。 相似文献
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【目的】克隆合作猪沉默信息调节因子3(silence information regulator 3,SIRT3)基因CDS区序列,并对其进行生物信息学分析,探究SIRT3基因在合作猪不同组织中的表达水平,为研究SIRT3基因功能奠定基础。【方法】试验选择3月龄合作猪公猪3头,采集心脏、睾丸、肺脏等组织,采用PCR扩增、Sanger测序等方法获取SIRT3基因CDS区序列,并通过Mega 7.0软件构建系统进化树;通过生物信息学在线软件分析SIRT3蛋白结构和功能;采用实时荧光定量PCR检测SIRT3基因在合作猪不同组织中的表达量。【结果】合作猪SIRT3基因CDS区长774 bp,共编码257个氨基酸。系统进化树结果显示,合作猪与家猪亲缘关系最近,与斑马鱼亲缘关系最远。SIRT3蛋白的分子质量为28.68 ku,理论等电点为5.81,不稳定系数为37.92,为稳定性亲水蛋白;该蛋白不存在跨膜区域,无信号肽,但存在2个低复杂度结构域,主要分布于内质网中;SIRT3蛋白的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三级结构模型预测结果与二级结构基本一致。实时荧光定量PCR结果显示,SIRT3... 相似文献