RNA二级结构预测算法的研究进展     

黄伊子  李都悦  刘伟  周玮 《湖南农业科学》2014,(9):3-8

在简要介绍了RNA的基础知识之后,对RNA二级结构的定义、表示方法、数据库等内容进行了详细阐述,并重点探讨了RNA二级结构预测方法的原理、适用范围及优缺点.目前,传统的RNA二级结构预测方法有比较序列分析法和最小自由能算法;新进发展的算法有支持向量机算法、基于堆积协变信息与最小自由能算法、基于局部茎搜索的算法、基于快速动态权重匹配算法、免疫粒子群算法、基于茎区的自由能算法、质心法.经过预测精度、复杂度、预测假节能力的对比,发现基于堆积协变信息与最小自由能算法和基于快速动态权重匹配算法,预测结果比较理想.  相似文献   

RNA二级结构预测算法的研究进展     

黄伊子  李都悦  刘伟  周玮 《湖南农业科学》2014,(18)

在简要介绍了RNA的基础知识之后,对RNA二级结构的定义、表示方法、数据库等内容进行了详细阐述,并重点探讨了RNA二级结构预测方法的原理、适用范围及优缺点。目前,传统的RNA二级结构预测方法有比较序列分析法和最小自由能算法;新进发展的算法有支持向量机算法、基于堆积协变信息与最小自由能算法、基于局部茎搜索的算法、基于快速动态权重匹配算法、免疫粒子群算法、基于茎区的自由能算法、质心法。经过预测精度、复杂度、预测假节能力的对比,发现基于堆积协变信息与最小自由能算法和基于快速动态权重匹配算法,预测结果比较理想。  相似文献   

miRNA分析研究进展     

李都悦  黄伊子  刘伟  周玮 《湖南农业科学》2014,(16)

介绍了miRNA的形成、调控机理、在生物体内的含量等内容,总结了目前用于miRNA分析的三种方法——qRT-PCR、DNA芯片和RNAsequencing(RNA-seq),并分析了其优缺点及适用范围,最后提出了miRNA的预测软件的原理及使用困难等。  相似文献