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为揭示麻疯树（Jatropha curcas）杂交子代与亲本间基因组甲基化变化规律,以1组亲缘关系较远且差异较大的亲本杂交构建的麻疯树遗传群体为材料,采用AFSM技术挖掘麻疯树DNA甲基化位点,比较不同材料的甲基化水平,对其进行功能分析。结果表明：共检测出537 234个甲基化位点,杂交子代DNA甲基化水平（0.29）显著低于2个亲本（0.39和0.35）。对不同全甲基化水平的样品进行功能分析,结果发现均富集于催化活性和蛋白结合,而相对于mCCGG全甲基化水平,CmCGG全甲基化水平样品还富集于大分子复合物、细胞器等细胞组分,以及发育过程、生物过程、细胞过程、代谢过程等生物学过程。这对于进一步从表观遗传学角度揭示麻疯树维持必要的遗传稳定性形成的内在机制具有重要意义。 相似文献
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为研究海南野生益智果实代谢产物与代谢差异,于5月份果实成熟期早期采集海南益智来研究其挥发油化合物特征。本研究选取20组表型差异较大的海南典型野生益智果实为研究对象,利用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)的代谢组学技术分析其代谢产物。共鉴定出239种代谢物成分,其中共有代谢物202种,差异代谢物37种。与成熟期益智果实挥发油化合物以倍半萜类和黄酮类为主不同,本研究发现在益智果实发育早期其果实挥发油化合物中特征性化合物大多为萜类和杂环化合物,其中相对含量高的为特征化合物包括4-(2-氨基乙基)吡啶、异-3-叔丁基乙酸酯等。通过KEGG富集分析发现,所有化合物共富集到了8条不同的代谢通路,其中6,6-二甲基-双环(3.1.1)庚-2-烯-2-甲醛、柠檬醛B、(-)-β-双萜烯和月桂烯4种化合物在不同代谢通路的富集中发挥着更重要的作用。本研究对采集的益智果实挥发油进行分析,比较了其中的代谢物成分,获得的结果可为后续益智人工栽培研究、育种和其在医药、食品等行业中的进一步开发应用提供科学依据。 相似文献
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为了对巴西木薯种质资源进行遗传多样性、亲缘关系和群体遗传结构分析,本研究利用了7946个SNPs和1997个InDels分子标记,通过ADMIXTURE软件进行群体结构分析、GCTA软件进行主成分分析。结果显示,巴西木薯被划分为9个亚群。这与利用PHYLIP进行的聚类分析结果大概一致,其中亚群1、亚群2、亚群4、亚群6和亚群8能较好地分别聚在一起,而其他亚群中的样品大致能聚在一起,且样品间有一定的交叉。巴西木薯种质资源遗传多样性指数(0.274)高于中国、尼日利亚等,其中巴西木薯亚群5具有相对较高的遗传多样性水平(0.29)。巴西木薯各亚群的群体遗传分化程度较低(群体分化指数在0.03~0.15之间),但高于中国木薯种质资源的群体分化指数。各木薯材料间的遗传距离变幅为0.084~0.297,平均遗传距离为0.228。本研究结果可为后续关联分析发掘优良等位基因及引种提供依据。 相似文献
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