仿刺参cDNA文库构建以及序列分析          下载免费PDF全文

徐赛涛  丛丽娜  朱蓓薇 《中国水产科学》2007,14(7)

<专刊>= <栏目>=研究论文 <图片>= <表格>= <连载>= <来源>= <中图分类号>=Q785 <主题分类>= <行业分类>= <本刊专题>= <本刊编号>=1005-8737-(2007)07-007-05 <基金项目>=国家自然科学基金(30571449)；973计划前期研究(2006CB708210).  相似文献   

仿刺参cDNA文库构建以及序列分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

徐赛涛  丛丽娜  朱蓓薇 《中国水产科学》2007,14(Z1)

应用Gubler-Hoffman cDNA Library Construction技术,构建仿刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库.测试结果表明,库容量为2.0×106 pfu/mL,利用PCR方法检测cDNA文库插入DNA片段的大小,其长度范围在0.5～4.1 kb,插入片段平均长度为1.3kb,表明该文库达到建库要求,可用来筛选低丰度mRNA的基因克隆.随机挑选100个1kb以上的cDNA克隆进行测序分析,发现有25条EST序列和网上公布的其他物种的序列相似性较高,这些基因与刺参能量代谢和蛋白水解相关.其中发现的几个重要基因,如编码遍在蛋白以及缬酪肽蛋白等的基因,可能与仿刺参自溶过程的蛋白酶水解和细胞凋亡事件相关,进一步的研究还在进行.另有49条EST序列相似性较低,推测可能是功能未知的新基因.仿刺参cDNA文库的成功构建,为下一步大量EST序列分析和功能性新基因的发现,以及从基因水平认识仿刺参这一特殊棘皮动物的生长、发育和代谢规律奠定了基础.  相似文献