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为准确鉴定矩镰荚苜蓿(Medicago archiducis-nicolai)及其近缘种花苜蓿(M.ruthenica )、阔荚苜蓿(M.platycarpos )和毛荚苜蓿(M.edgeworthii )，利用DNA条形码技术对4个物种的ITS2序列进行注释、比对、检验，计算种内种间遗传距离，邻接法(neighbor-joining，NJ)构建系统发育树，通过RNAfold web server预测4个近缘种的ITS2二级结构。结果显示，矩镰荚苜蓿及其近缘种的ITS2序列长度为220~221 bp，稳定性好；种间遗传距离(0.004 55~0.022 73)明显大于种内遗传距离(均为0)，存在明显的“Barcoding Gap”区域；NJ系统发育树显示，毛荚苜蓿聚为一支，矩镰荚苜蓿、花苜蓿和阔荚苜蓿聚为另一支，然后矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿又各自形成单系；在二级结构中，矩镰荚苜蓿与阔荚苜蓿、毛荚苜蓿存在明显差异，但与花苜蓿极为相似，难以区分。分析表明：除花苜蓿外，以ITS2序列作为条形码并辅以二级结构，可以达到对矩镰荚苜蓿、阔荚苜蓿和毛荚苜蓿准确、快速鉴定的目的。 相似文献
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为了筛选适于鉴定易混淆种矩镰荚苜蓿(Medicago archiducis-nicolai)和花苜蓿(M.ruthenica)的DNA条形码，本研究采集了两近缘种的113个样本，对6个候选条形码序列(通用序列rbcL,psbA-trnH,trnL-trnF,trnK-matK,ITS2和新序列GA3ox1)进行PCR扩增、测序和序列比对，经过barcoding gap分析、wilcoxn检验以及构建NJ系统发育树评价各序列的鉴定能力。结果显示：6条候选序列的扩增和测序成功率在85%以上；rbcL序列在两近缘种间不存在变异位点，其余5条候选序列各有不同的种内变异和种间变异；5条候选序列的种间最小遗传距离均大于种内最大遗传距离，GA3ox1,ITS2和psbA-trnH序列在种内种间存在明显的“Barcoding Gap”区域；在候选序列构建的NJ系统进化树中，利用GA3ox1和psbA-trnH,矩镰荚苜蓿和花苜蓿均能各自形成单系，但trnL-trnF,trnK-matK和ITS2不能将两个近缘种区分开。通过分析，我们推荐使用核编码基因GA3ox1作为鉴定矩镰荚苜蓿... 相似文献
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【目的】植物区系分析是科学开发利用和保护植物资源的重要前提。祁连山金强河流域位于青藏高原与黄土高原交界处，区位特征独特，莎草科(Cyperaceae)植物作为该地区的优势植物，对其进行资源调查和区系分析尤为重要。【方法】通过搜集文献、核实鉴定馆藏植物标本，编制祁连山金强河流域莎草科植物名录，分析莎草科植物科属特征和区系成分。【结果】祁连山金强河流域莎草科植物共有 6 属 53 种(4 变种)，其中，多种属 2 个，为薹草属(Carex)和嵩草属(Kobresia)，寡种属 1 个，为扁穗草属(Blysmus)，单种属 3 个 ，为三棱草属(Trichophorum)、细莞属(Bolboschoenu)和蔺藨草属(Isol- epis)，特有种 9 种；从各属包含的种数上来看，单种属和寡种属所含种的比例只占 5. 66 %和 3. 77 %，而多种属所含种的比例达到 90. 57%，占据明显的主导地位；植物区系成分包括世界分布型和北温带型 2 个分布区类型，世界分布型有 4 属 40 种，北温带型有 2 属 13 种。【结论】祁连山金强河流域莎草科植物区系成分总体简单，但莎草科植物资源丰富，特有种和世界分布型植物数量较多，具有重要的开发利用潜力。 相似文献
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