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旨在利用两种统计模型对中国肉用西门塔尔牛的胴体重和骨重两个屠宰性状进行全基因组关联分析(GWAS),并比较不同模型的分析结果,促进GWAS的方法研究。本研究以1 301头中国肉用西门塔尔牛为试验材料,通过实地采集和测量获得样品和表型数据,通过提取样品DNA,并利用Illumina BovineHD(770K)芯片分型获得基因型数据,采用线性混合模型(LMM)和复合区间定位-线性混合模型(CIM-LMM)两种模型进行关联分析,定位影响目标性状的显著SNPs及候选基因;同时对两种模型的GWAS结果进行对比,探讨模型的优劣。结果表明,CIM-LMM检测到了LMM检测的所有显著SNPs(P0.05),显示出更高的统计效力。本研究共识别8和7个SNPs分别与胴体重、骨重显著关联,其中有2个SNPs与这两个性状都相关。这些SNPs主要分布于3、5、6、10、14、16、17号染色体上,其中6号和14号染色体显著SNPs分布较为集中;最终找到了11个候选基因,同时探讨了GCNT4、ALDH1A2、LCORL和WDFY3等基因的功能。本研究为中国肉用西门塔尔牛屠宰性状的遗传机理做了探索,并且为GWAS研究方法开拓了新的思路。 相似文献
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为了选育中国西门塔尔牛肉用品系,本研究从中国肉用西门塔尔牛育种实践出发,确定了适应当前中国肉用西门塔尔牛的育种目标性状和选择性状。采用差额法计算出各目标性状的边际效益,并通过各目标性状表型值的遗传标准差校正边际效益,得到相应育种目标性状的经济权重。结果表明,中国肉用西门塔尔牛近期的育种目标性状主要包括生长发育性状（断奶重、育肥期日增重、18月龄体重）、胴体性状（胴体品质、屠宰率、净肉率）及繁殖性状（初产年龄、产犊间隔和留群时间）。在现有市场和生产条件下,上述育种目标性状的边际效益分别为17.93元/kg、16.2元/kg、7.17元/kg、297.99元/级、497.82元/%、594.46元/%、-3.62元/d、-26.55元/d、232.75元/y,3类性状中生长发育性状、胴体性状及繁殖性状的经济权重之比为31.49%：15.86%：52.65%,约为2：1：3,繁殖性状占总经济权重最高,其次是生长发育性状和胴体性状。综上所述,在中国肉用西门塔尔牛育种过程中,繁殖性状具有最重要的地位,需加强繁殖性状的选择力度。 相似文献
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