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为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记,采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊‘斯丹泰勒’（Coreopsis lanceolata ‘Sterntaler’）的叶片进行转录组测序。结果表明：通过转录组测序共得到42 958条Unigene,利用MISA软件共检测出个6 546个SSR位点,平均分布距离6.36 kb。除单核苷酸外,重复类型以二核苷酸和三核苷酸为主,分别占总数的19.28%和30.13%,二者优势重复单元和占比分别为AG/CT （57.30%）和AAT/ATT （27.94%）。通过Primer3软件设计得到4 499条引物,在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的引物,扩增出的166个条带全部具有多态性。通过UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.460时可将100个栽培金鸡菊种质划分为7类,其遗传相似系数介于0.542 2~1之间,平均为0.747 6。金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料。本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供了理论依据。 相似文献
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研究了沙漠金鸡菊和鬃毛金鸡菊在不同浓度盐溶液(NaCl)和干旱胁迫(PEC-6000)下的萌发特性.结果 显示,随着溶液浓度的增加,2种植物种子的发芽率、发芽势等指标整体呈下降趋势.在PEG-6000浓度小于15％时,沙漠金鸡菊和鬃毛金鸡菊的发芽率都在80％以上,而在PEG-6000溶液浓度为25％时,2种金鸡菊的发芽率分别为10.7％、50％,均与对照组差异显著;在NaCl溶液处理中,对照组的发芽率、发芽势等指标显著高于其他组,当NaCl溶液浓度小于6 g/L时,2种金鸡菊的发芽率均高于70％,当NaCl溶液高于8 g/L时,2种金鸡菊的各项指标显著降低,且幼苗无法正常生长.综上所述,2种金鸡菊均具有较好的耐盐碱性和抗旱性,在干旱或盐碱土地的园林应用方面具有很高的开发潜力. 相似文献
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为进一步利用ISSR分子标记进行铁线莲遗传多样性分析、种质资源鉴定、遗传图谱构建等研究,本试验以卷萼铁线莲DNA为模板,采取L9(34)正交试验设计,对影响扩增反应的模板DNA含量、目标引物浓度、Master Mix、循环数4个主要因素进行优化,从而得出适宜于铁线莲的ISSR-PCR反应体系.并利用筛选出的12条多态性高的引物构建了16种野生铁线莲的指纹图谱.结果 表明,在25 μL反应体系中,各因素的最佳配比为模板DNA用量40 ng,引物浓度6μmol/L,Master Mix用量14 μL,循环数40个.并且利用最优体系构建了16种野生铁线莲的遗传指纹图谱.该体系的建立为ISSR技术在铁线莲遗传多样性研究、遗传指纹图谱构建、分子标记辅助育种等研究提供了理论基础.指纹图谱的构建可以有效的对16种野生铁线莲进行区分和鉴定. 相似文献
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