熊猫EST序列的生物信息学分析     

张帅团  邵俊红  白俊艳  樊红灯  陈梦柯  牛程炜  王龙威  李静云  王新乐  王亮 《当代畜禽养殖业》2021,(5):29-31

熊猫是我国的国宝,是生物界的"活化石".但是由于种种原因,熊猫的数量逐渐减少,其中繁殖率低是一个很重要的因素.所以通过各种方法提高熊猫的繁殖率就显得尤为重要,而熊猫基因组序列图谱的绘制不失为解决这一问题的好办法之一.本文运用生物信息学方法分析了公共数据库中熊猫EST序列,以期为熊猫基因组学研究提供科学依据.研究结果表明:从NCBIdbEST数据库中获得709条熊猫的EST,并对其预处理、拼接和聚类,获得46条Contig和527条singlets.利用在线软件SSRIT对636条EST进行SSR筛选分析,共获得150个SSR,出现频率26.17％,平均每1.79 kb就出现一个SSR.熊猫EST—SSR中二核苷酸SSR最多为124条,比例为82.67％;其次是三核苷酸,共有21条,比例为14％;四核苷酸共有5条,比例为3.33％;不包含五、六核苷酸.熊猫EST—SSR一共有31种重复基元,其中出现最多的是AT/AT和AG/CT.在筛选出的150条SSR中,重复数为4次的SSR有117个,重复数为5次的有19个,6次的有8个,7次的有1个,8次的有3个,9次的有2个.对部分含有SSR的EST序列进行了开放阅读框查找和理化性质分析,其中除6条未能找到开放阅读框外,其他的EST都能找到开放阅读框,最大的开放阅读框为561 bp,最小的为75 bp.  相似文献   

新美系长白猪21日龄重的影响因素分析     

牛程炜  邵俊红  陈宇  白俊艳  任行  张帅团  李凯  董智豪  王新乐  李静云 《当代畜禽养殖业》2021,(4):10-11

长白猪早期的健康成长对长白猪的育肥有着至关重要的作用,研究长白猪21日龄重的影响因素,分析在生产中如何利用好这些因素,可以更好地进行长白猪的生产管理,同时把握好各种因素之间的相互作用关系并比较其影响程度.本研究对正阳诸美种猪场2008～2010年所记录的关于21日龄重的资料进行了影响因素分析,研究结果表明,公仔猪的21...  相似文献   

绵羊乳房炎的危害与防治     

时帅峰  李海涛  马小军  庞彦生  张帅团 《今日畜牧兽医》2018,(4)

绵羊乳房炎是由病原微生物感染而引起的羊的乳头、乳腺、乳池的局部炎症,病原菌微生物引起绵羊乳房炎与奶牛乳房炎不同的是种类相对较少,主要有葡萄球菌和大肠杆菌。乳房炎的危害不仅给养殖业造成巨大的经济损失,使绵羊产奶量下降,甚至还会影响泌乳功能,最终使母畜被迫淘汰。目前对绵羊乳房炎的控制主要采取改善环境和药物治疗等措施,抗生素治疗是首选。  相似文献