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试验旨在了解2019年广西地区牛星状病毒（bovine astrovirus,BoAstV）在水牛群中的流行情况及毒株序列特征,并进行遗传进化分析。从2019年广西南宁、贵港、北海、横县、灵山5个地区15个水牛场共采集297份水牛粪便样品,使用Trizol法抽提样本总RNA后,利用半巢式RT-PCR方法对收集到的粪便样品进行检测,并将阳性样品连接到pMD18-T载体进行测序,对测序结果进行同源性分析及系统进化树构建。结果显示,BoAstV感染的水牛场阳性率为40.00%（6/15）,样品总阳性率约为11.11%（33/297）,1~180日龄犊牛感染率最高为18.75%（27/144）;有19株BoAstV ORF1b基因测序成功,核苷酸序列同源性为53.9%~99.3%,氨基酸序列同源性为12.1%~98.5%。遗传进化分析发现,广西地区流行的BoAstV主要分为4个亚群：第一亚群是NNC-286、HX-3、HX-4和NNA-14,与新型的神经嗜性的牛星状病毒BoAstV NeuroS1和BoAstV BH89/14等Mamastrovirus 13亚群的序列之间有较高的亲缘性;第二亚群是NNA-12、NNA-13、NNA-17、NNA-11,与水牛星状病毒（buffalo astrovirus）亲缘性较近,属于水牛星状病毒分支内;第三亚群是HX-1、HX-5、HX-6和BH-C22,与经典的牛星状病毒毒株BoAstV B170-HK亲缘性较近;第四亚群包含NNA-7、NNA-15、NNA-6、NND-S2、NND-S16、NNC-296与BH-C14,与广西BoAstV地方流行毒株的亲缘性较近。不同基因型BoAstV感染了广西不同地区的水牛群体,本试验在广西地区发现了类神经嗜性BoAstV毒株感染水牛的情况,为进一步全面了解该病毒的流行病学和生物学特性提供参考。 相似文献
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