牦牛CAPS基因克隆及生物信息学分析     

李卿正  张玉洁  黄鑫蕊  卢丹  曹萍  马志杰  李瑞哲 《青海畜牧兽医杂志》2023,(4):1-5+38

钙磷蛋白(calcyphosine, CAPS)是一种钙结合蛋白,对维护生物体内钙磷平衡起着重要作用。本研究克隆了牦牛CAPS基因的CDS区序列,分析了其核苷酸序列,并进行了生物信息学分析。结果表明,牦牛CAPS基因CDS区全长570 bp,编码189个氨基酸;编码蛋白的分子式为C₉₀₅H₁₄₃₄N₂₆₆O₂₉₇S₈,分子量为21 049.43 Da,理论等电点为4.69,脂溶指数为75.29,不稳定指数为37.52,是疏水性稳定蛋白;系统进化分析表明,牦牛CAPS基因CDS区与普通牛和瘤牛的基本一致,与水牛、绵羊和猪的序列一致性较高。本研究为深入研究牦牛CAPS的生理功能提供了参考资料。  相似文献   

基于mtDNA D-loop序列分析探究青海雪多牦牛的遗传多样性及母系遗传背景     

李瑞哲  马志杰  陈生梅  孙永刚  官却扎西  陈永伟  徐惊涛 《青海畜牧兽医杂志》2018,(2)

为从分子水平上探究青海雪多牦牛的母系遗传多样性及遗传背景,对33头雪多牦牛的线粒体DNA(mt DNA)D-loop区部分序列进行了测定,统计计算了多态位点、单倍型数目、核苷酸多样度和单倍型多样度。结果表明:在获得的636 bp D-loop序列中,排除3处插入/缺失后共检测到42处多态位点,其中单一多态位点9处,简约多态位点33处;共确定了19种单倍型,单倍型多样度为0.9000±0.043,核苷酸多样度为0.01173±0.00305,表明雪多牦牛具有丰富的母系遗传多样性;系统发育分析结果表明,雪多牦牛19种单倍型可分为2个支系,推测其具有2个母系起源。  相似文献   

牦牛输卵管壶腹部与峡部的转录组学差异分析     

李瑞哲  徐惊涛  马志杰  李文浩  彭巍  陈生梅 《中国畜牧杂志》2024,(5):225-232

输卵管是配子和受精卵的运输通道,在受精和早期胚胎发育中起重要作用。为深入研究牦牛输卵管不同解剖部位功能差异的分子基础,本研究对发情期母牦牛输卵管壶腹部、峡部进行了转录组测序,筛选出1395个差异表达基因,其中500个基因在壶腹部高表达,895个基因在峡部高表达。基因功能分析及通路富集结果表明,壶腹部上调差异表达基因主要与上皮细胞的完整性、细胞增殖、细胞突起、纤毛、精子运动性、受精过程有关,峡部上调差异表达基因主要与平滑肌收缩、胞外基质、解剖形态和系统发育、精子获能和储存有关。本研究从转录组层面解释了牦牛输卵管壶腹部和峡部形态结构及功能差异的原因,为进一步研究牦牛输卵管不同解剖部位的生理功能提供了基础数据。  相似文献   

牦牛谷胱甘肽过氧化酶1基因(GPX1)的克隆及系统发育分析     

李瑞哲  徐惊涛  马志杰  孙永刚  韩银仓  陈生梅 《青海畜牧兽医杂志》2021,(1):1-5

本研究克隆了牦牛谷胱甘肽过氧化酶1GPX1基因的CDS区序列,分析了其核苷酸序列,并进行了系统发育分析。结果表明,牦牛GPX1基因CDS区全长618 bp,编码205个氨基酸;经与GenBank中其他物种GPX1基因CDS区比对,牦牛GPX1基因CDS区与普通牛和瘤牛完全一致,与水牛、绵羊和猪的序列一致性较高,与其他哺乳动物序列一致性较低。本研究为深入研究牦牛GPX1的生理功能提供了参考资料。  相似文献   

牛体细胞核移植中的异常重编程及提高核移植效率的措施     

李瑞哲  孙永刚  马志杰  陈生梅  徐惊涛 《家畜生态学报》2016,37(1):1-6

体细胞核移植技术具有重要的理论和实践价值,但是其成功率依然很低。目前普遍认为,核移植效率低下的原因是体细胞重编程不完全,即体细胞的表观印记未被完全去除,未能建立正确的胚胎基因表达模式,进而出现各种发育阻滞和异常。论文综述了近年来对牛体细胞核移植重编程机理的探索以及提高牛体细胞核移植效率的措施。  相似文献   

蘑菇底料等废弃物对蚯蚓生长发育的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

李瑞哲  张红垒  郭建伟  朱重伟  邢小娟  徐廷生  刘宁 《中国食用菌》2010,29(2):32-33

用蘑菇底料、牛粪、猪粪、兔粪等4种原料按不同的比例配合发酵,饲喂蚯蚓。饲养30d后,统计蚯蚓生长状况。结果表明,蘑菇底料与猪粪、兔粪相配合,蚯蚓体重增长较快。  相似文献