基于SOFM神经网络的核心种质取样算法     

林喆  郑丽敏  李自超  张洪亮 《种子》2006,25(5):4-8,16

介绍了核心种质和自组织特征映射网络的基本概念，使用自组织特征映射网络的自组织特性对种质性状数据进行了聚类，利用聚类的分组结果，提取核心种质，通过对核心种质的各种参数的检验并与完全随机取样和一般的系统聚类的对比。结果表明，SOFM的取样算法，是一种比较有效快捷的算法，可以在实际中加以应用。  相似文献   

稻米外观和碾磨品质QTL定位及其与土壤水分环境互作分析     

穆平  郭咏梅  刘家富  卢义宣  李自超 《农业生物技术学报》2007,15(4):654-660

本文利用旱稻品种IRAT109和水稻品种越富的花培DH群体的116个株系为作图群体，采用混合线性模型QTL定位方法，在水、旱2个土壤水分环境下对粒长(GL)、粒宽(GB)、长宽比(LWR)和垩白率(C)4项外观品质性状和糙米率(BR)、精米率(MR)、整精米率(HR)3项碾磨品质性状进行QTL定位及QTL与环境互作分析。在水、旱2种条件下对DH群体差异显著性分析结果表明，糙米率、精米率和长宽比差异不显著,而整精米率、粒长、粒宽、垩白率差异极显著。外观品质性状在水、旱栽培条件下变化较大，即在旱种环境下稻米粒形变小（粒长、粒宽减小）、变细（长宽比增大）垩白率大幅度下降。碾磨品质性状在双亲间均有差异，其中整精米率差异较大；且在两种土壤水分环境条件下均有变化，即在旱栽条件下两亲本的糙米率和精米率均降低，IRAT109分别减少了5.8%和5.5%，越富分别减少了11.7%和11.5%。共检测到11个加性效应QTL与稻米外观和碾磨品质性状7项指标有关，分别位于第1、3、5、6、7、10、11染色体上，单个QTL对性状的贡献率在3.15～21.42%之间，位于第1、7 染色体上2个控制整精米率的QTL存在显著环境互作，单个QTL与环境互作效应的贡献率分别为9.59%和13.58%。在第1染色体RM295标记附近同时检测到5个QTL，Qgc1a 、Qgc1b 、Qlwr1、QMr1b和QHr1，分别控制粒长、长宽比、精米率和整精米率，且该QTLs簇在2个环境下能稳定地被检测到。同时，还检测到10对上位性QTLs，所有上位性QTL都发生在不同染色体之间，其中，控制整精米率的4对QTL与土壤水分环境显著互作，其环境互作贡献率分别为14.29%、12.28%、10.56%和13.47%。控制粒长、粒宽、长宽比的6个加性QTL（Qgc1a、Qgc1b、Qgc5、Qgw6、Qlwr1、Qlwr10）与环境之间互作较小，在品质育种中可利用分子标记对其进行辅助选择，提高育种效率；而对于基因型×环境互作效应大的整精米率、垩白率应在特定环境(如土壤缺水条件)下进行选择，在特定水分胁迫条件选择目标亲本，并将抗旱基因导入该亲本方可选到品质较优的抗旱品种。  相似文献   

稻米品质性状与产量性状及籼粳分化度的相互关系研究   总被引：19，自引：2，他引：19  

吴长明  孙传清  付秀林  王象坤  李自超  张强 《作物学报》2003,29(6):822-828

通过QTL的连锁关系和性状相关性研究表明,供试的籼粳重组自交系群体的籼粳分化程度与籼、粳稻的直链淀粉含量高低无直接关系,籼粳分化度与胶稠度、碱消值、蛋白质和粗脂肪含量之间呈现显著相关和密切连锁关系;直链淀粉含量的高低不是影响稻米食味品质的关键因素,胶稠度和碱消值是影响稻米食味品质的最重要因素;单株产量越高,  相似文献   

植物遗传资源核心种质研究现状与展望   总被引：62，自引：2，他引：62  

李自超  张洪亮  孙传清  王象坤 《中国农业大学学报》1999,4(5):51-62

近年来急剧增加的遗传资源数量给种质资源的保存、研究与利用带来了很大困难。为解决这一矛盾,Frankel（1984）和Brown（1989）提出并发展了核心种质（CoreCollection）的概念,即以最少的遗传资源份数最大限度的代表该物种的遗传多样性;至今全世界在硬粒小麦、花生和一年生育情等30余种植物上已经进行了核心种质研究;本文对有关核心种质构建的理论依据、开展核心种质研究的步骤、方法和内容以及核心种质的检验指标作了全面系统的阐述;此外,作者在Frankel的核心种质的概念的基础上,提出核心种质还应包含有实际应用价值的优异基因,并强调核心种质应该是一个动态变化的群体。  相似文献   

中国普通野生稻初级核心种质取样策略   总被引：12，自引：0，他引：12  

余萍  李自超  张洪亮  曹永生  李道远  王象坤 《中国农业大学学报》2003,8(5):37-41

以国家品种资源库编目入库的中国普通野生稻种质5571份为材料、19个分类和形态性状的数据比较研究了中国普通野生稻的核心种质总体取样比例和取样策略，以获得最佳初级核心种质。设3个总体取样比例5％、15％和25％，取样方案分3个层次即分组原则、组内取样比例和组内取样方法。分组原则为省、纬度、生长习性和单一性状及不分组的大随机；组内取样比例为对数法、平方根法、遗传多样性指数和简单比例法；组内取样采用随机和聚类2种方法。结果表明，当总体取样比例从5％增加到15％时，所取得核心种质的表型保留比例有比较大的增幅，而比例由15％增加到25％时，表型保留比例变化不大，因此认为15％的取样比例较为合适；取样方案以采集省份分组，组内以对数比例法聚类取样效果最好。最终根据这一方案在计算机上编程取样860份，其多样性指数为1．1015、变异系数为16．87，表型方差为0．8546。3个检测参数值比原始种质库都有明显的提高。此外，根据国家种质资源库表型数据人工定向取样60份，建立了920份材料的中国普通野生稻初级核心种质。  相似文献   

水、陆稻根部性状的研究   总被引：21，自引：1，他引：21  

凌祖铭  李自超  余荣  穆平 《中国农业大学学报》2002,7(3):7-11

选用来自日本、中国华北、东北、西北等地的粳型水稻品种8个和陆稻品种7个，在大田旱种和雾培条件下测其根系性状和叶片水势等。结果表明，在2种栽培条件下水、陆稻的根长、根数、根基粗、根中粗和根体积等性状相关显著；水、陆稻不同的品种间根系性状的差异均达极显著水平，陆稻品种的根比水稻品种的长、根的基部粗。陆稻品种的叶 片水势比水稻高，并且与根长、根基粗相关显著；水陆稻幼苗4叶期根基粗和灌浆期的根基粗相关极显著。因此水、陆稻苗期根基粗可以作苗期初步鉴定抗旱性的一种指标。  相似文献   

云南两系杂交稻优势生态型研究   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

杨久  卢义宣  李自超 《中国农业大学学报》2006,11(4):1-6

农作物杂种优势群或杂种优势生态型研究可有效地指导杂种优势亲本组配和利用。本研究用4个云南不同籼粳生态型恢复系,分别与3个光(温)敏核不育系测交,通过对父本和F1产量及产量构成因素分析,在12种杂种优势组配模式中筛选出2个云南两系杂交稻的杂优配组模式:云南偏籼生态型恢复系与籼型蜀光612s组配,即籼×偏籼配组模式具有较强的杂种优势;云南粳生态型恢复系与95076s组配,即粳×粳配组模式,在云南高原稻区由于双亲皆为粳稻,抗寒性强,结实率高,具有较强的杂种优势。在籼生态型的亚型内杂种优势表现不相同,培矮64s和蜀光612s与籼生态型测交F1的单株产量无明显竞争优势,但是它们与两系籼型恢复系亚生态型测交具有明显的杂种优势,说明云南两系籼型恢复系亚生态型都是培矮64s、蜀光612s的优势生态型。  相似文献   

粳稻分子标记遗传分化与杂种优势关系的研究   总被引：2，自引：1，他引：2  

史延丽  王坚  李自超 《西北农业学报》2008,17(5):166-170

利用9个不同生态类型的62份水稻亲本材料,以生态型为单位进行双列杂交,配制988个组合,研究杂种一代的对照优势和超中亲优势。利用55对SSR引物进行遗传多样性分析,选择分布于水稻12条染色体的37对SSR引物,在62个粳稻品种间共检测出161个等位基因,平均每对SSR引物检测出2~11个等位基因,平均为5.1个。SSR分子标记遗传距离与杂种优势的相关分析表明,分子标记遗传差异与单株产量、穗数和穗粒数有显著正相关。  相似文献   

美国稻与籼稻和粳秀杂交配合力及遗传参数研究     

李自超  王象坤 《中国农业大学学报》1999,4(1):49-55

以１３个美国水稻品种为母本分别与籼稻、粳稻杂交配制了６组ｐ×ｑ不完全双列杂交试验，研究了美国稻的８个性状的一般配合力，特殊配合力，遗传力和遗传参数，结果表明， 同一美国品种在Ａ×Ｈ和Ａ×Ｋ间各性状的配合力及遗传参数均有一定的差异，不同美国品种在同一组合类型中也有一定的差异。  相似文献   

人工森林公园规划设计易出现的问题   总被引：1，自引：0，他引：1  

王联营  李建亭  李自超 《河南林业科技》2006,26(3):46-46

人工森林公园普遍存在因设计问题造成的一些地块造林失败和林分结构简单、生态脆弱问题。本文通过对工作实践中成功经验的总结,为人工森林公园的规划设计,林分改造提供一些参考。  相似文献