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试验旨在对豫西脂尾羊诱导细胞凋亡DNA片段化因子45样效应因子A(cell death-inducing DNA fragmentation factor 45-like effectors A,CIDEa)基因进行克隆及生物信息学分析,并检测其在豫西脂尾羊不同组织中的表达。以豫西脂尾羊脂肪组织RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增并克隆豫西脂尾羊CIDEa基因完整CDS区序列,对测序结果进行了相关生物信息学分析,并对CIDEa基因在豫西脂尾羊心脏、肝脏、肺脏、脾脏、肾脏、瘤胃、小肠、背最长肌、皮下和内脏脂肪组织中的表达进行了分析。结果显示,豫西脂尾羊CIDEa基因CDS区序列长660 bp,编码219个氨基酸;豫西脂尾羊与绵羊、水牛、黄牛、藏羚羊、猪和人的CIDEa基因同源性分别为99.1%、96.8%、96.2%、98.8%、85.0%和79.4%。蛋白理化性质分析表明,CIDEa蛋白分子质量为24.38 ku,理论等电点(pI)为9.12,属于碱性蛋白。跨膜结构和信号肽预测分析表明,CIDEa蛋白不含跨膜结构和信号肽。亚细胞定位分析表明,豫西脂尾羊CIDEa蛋白分布在细胞质(47.8%)、线粒体(26.1%)、细胞核(17.4%)、液泡(4.3%)和内质网(4.3%)。蛋白质三级结构预测发现,CIDEa蛋白结构具有2个α-螺旋、4个β-折叠及一些无规则卷曲。实时荧光定量PCR结果表明,CIDEa基因在豫西脂尾羊脂肪组织(皮下和内脏脂肪组织)中表达量较高,其他组织中表达量从高到低依次为小肠、肝脏、脾脏、瘤胃、心脏、肾脏、肺脏、背最长肌。这些结果可为进一步研究CIDEa基因在肉羊脂质代谢中的功能及羊肉品质调控提供基础资料。 相似文献
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家畜的脂肪主要存在于皮下、内脏、肌内等部位,脂肪库中的脂肪分配到各部位的脂肪是按照内脏脂肪、皮下脂肪和肌内脂肪的先后顺序。脂肪组织的生长是影响动物生长效率、瘦肉率和肉品质的关键因素,且皮下脂肪和内脏脂肪沉积会导致饲料利用率下降,造成资源浪费,因此深入解析不同部位脂肪的调控机制,不仅可以阐明肌内脂肪的特异性调控方式,还可为畜禽肉品质改良提供有效方案,减少资源浪费。本文总结了部分lncRNA、miRNA、circRNA和脂肪调控相关基因对脂肪生成机制的调节作用,重点分析了它们在家畜不同部位脂肪沉积中的作用,为制定有效的脂肪沉积策略提供参考。 相似文献
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试验旨在对豫西脂尾羊诱导细胞凋亡DNA片段化因子45样效应因子A （cell death-inducing DNA fragmentation factor 45-like effectors A，CIDEa）基因进行克隆及生物信息学分析，并检测其在豫西脂尾羊不同组织中的表达。以豫西脂尾羊脂肪组织RNA为模板，采用RT-PCR方法扩增并克隆豫西脂尾羊CIDEa基因完整CDS区序列，对测序结果进行了相关生物信息学分析，并对CIDEa基因在豫西脂尾羊心脏、肝脏、肺脏、脾脏、肾脏、瘤胃、小肠、背最长肌、皮下和内脏脂肪组织中的表达进行了分析。结果显示，豫西脂尾羊CIDEa基因CDS区序列长660 bp，编码219个氨基酸；豫西脂尾羊与绵羊、水牛、黄牛、藏羚羊、猪和人的CIDEa基因同源性分别为99.1%、96.8%、96.2%、98.8%、85.0%和79.4%。蛋白理化性质分析表明，CIDEa蛋白分子质量为24.38 ku，理论等电点（pI）为9.12，属于碱性蛋白。跨膜结构和信号肽预测分析表明，CIDEa蛋白不含跨膜结构和信号肽。亚细胞定位分析表明，豫西脂尾羊CIDEa蛋白分布在细胞质（47.8%）、线粒体（26.1%）、细胞核（17.4%）、液泡（4.3%）和内质网（4.3%）。蛋白质三级结构预测发现，CIDEa蛋白结构具有2个α-螺旋、4个β-折叠及一些无规则卷曲。实时荧光定量PCR结果表明，CIDEa基因在豫西脂尾羊脂肪组织（皮下和内脏脂肪组织）中表达量较高，其他组织中表达量从高到低依次为小肠、肝脏、脾脏、瘤胃、心脏、肾脏、肺脏、背最长肌。这些结果可为进一步研究CIDEa基因在肉羊脂质代谢中的功能及羊肉品质调控提供基础资料。 相似文献
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