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【目的】 筛选不同温度下烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染后枯斑三生烟(Nicotiana tabacum var. Samsun NN)差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),研究lncRNA在枯斑三生烟抗性反应中的作用。【方法】 N基因的温度敏感性使枯斑三生烟在25℃时具备对TMV的抗性、在31℃抗性丧失,在这两个温度条件下对枯斑三生烟接种TMV和磷酸盐缓冲盐水(phosphate buffered saline,PBS),48 h后提取系统叶总RNA,构建链特异性文库后进行深度测序。对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90(N. tabacum var. TN90)基因组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估计lncRNA的表达水平。通过edgeR筛选差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),并利用qRT-PCR技术对这一结果进行验证。通过共定位及共表达分析预测DElncRNA的靶基因,通过参考基因组注释、GO和KEGG富集分析研究靶基因的功能。【结果】 4个处理共12个样本经lncRNA-seq各测得约8 000万条clean reads,共获得4 737条已知lncRNA、40 169条新lncRNA。其中64个lncRNA在不同温度条件下TMV侵染后存在差异表达,qRT-PCR测定结果显示这些lncRNA的测序正确率在80%左右,表明本研究所得测序数据具备较高的可信度。对DElncRNA进行靶基因预测,发现一些基因同时被25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶向。靶基因注释功能丰富,主要参与植物抗病、激素和代谢等生理过程。部分可能与激素通路相关的lncRNA,在25℃下TMV侵染时呈现下调趋势,而在31℃下TMV侵染则呈现上调趋势。GO富集分析显示靶基因主要参与构成膜、囊泡等组分,具备钙、钾离子通道抑制剂活性等分子功能,使相应离子得以转运引发随后的反应,同时也参与发病、抗原加工和呈现、细胞分裂素代谢等生理过程。KEGG分析发现靶基因显著富集在植物激素信号转导通路,25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶基因同时富集在激素信号传导、ABC运输蛋白、苯丙烷类生物合成等通路。【结论】 不同温度(25℃和31℃)条件下TMV侵染枯斑三生烟后,长链非编码RNA差异表达,DElncRNA通过作用于激素信号传导、物质转运等过程参与寄主系统获得性抗性反应。研究结果可为揭示植物系统获得性抗性中lncRNA的调控功能以及新型抗病毒技术开发提供依据。 相似文献
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阐述了室内绿化的发展历程、主要功能以及室内绿化植物应用的种类、布置方式、摆放手法,提出室内绿化植物应用的发展方向与措施. 相似文献
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介绍了中国古代门窗和现代门窗的发展历程,阐明了各时期门窗的特点及发展状况;探讨了古代门窗形制的变化特点、现代门窗用材和制作工艺的发展历程。 相似文献
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环境条件对重阳木生长的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
对重阳木以通径分析方法分析其生长状况与环境条件的关系。结果表明:多行的重阳木与其生长状况呈较强的正相关关系,除直接作用外,根系半深埋,根系损害以及地面硬化等均可通过其对生长状况产生影响;根系正常与冠幅生长相关性较强,除直接作用外,多行,根系伤害以及地面硬化程度均可通过其对冠幅生长产生影响;单行的重阳木与树干生长关系密切,除直接作用外,根系深埋、根系伤害程度以及地面硬化程度均可通过其对树干生长产生影响;根系深埋推迟发芽时间,除直接作用外,单行以及地面硬化均可通过其对发芽时间产生影响。 相似文献
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秦芋32号(原代号:康0102-5)是2000年以秦芋30号作母本,89-1优系作父本,有性杂交获得实生种子,经育种圃、鉴定圃选育而成。2011年3月申报国家农作物品种审定委员会待审,2011年10月通过审定。2007~2009年参加国家级马铃薯品种中晚熟西南组繁种及区域试验;2010年国家西南组生产试验平均产量1 443 kg/667 m2,比对照米拉增产12.5%。块茎干物质含量18.5%、淀粉含量11.8%,Vc含量14.2 mg/100 g,还原糖含量0.29%,粗蛋白含量2.1%。抗病性接种鉴定:中抗PVX和PVY,抗晚疫病。 相似文献
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美国得克萨斯大学分子遗传学及微生物学教授马尔科姆*布朗及研究生荣峰 《湖北植保》2001,1(1):21-21
美国得克萨斯大学分子遗传学及微生物学教授马尔科姆·布朗及研究生荣峰 (音 )等人组成的研究小组 ,通过对棉花种子进行基因工程处理 ,使棉籽直接长出了棉花纤维。这一技术 ,可省去烦琐的棉株生长、采摘棉桃和去除棉籽的过程。该研究小组的这一成果 ,已在实验室里获得成功。他们把从棉桃中取出的棉种 ,作基因工程处理好 ,撒在专门介质的表面上 ,在以后的 5天内 ,棉种的表面就会长出芽来。而这些芽 ,实际上都是棉花小纤维 ,不过 ,它的独特细胞 ,看起来特别像木质细胞 ,而不太像棉花细胞。是基因工程处理 ,促发了一些细胞组织结构 ,并改变了生… 相似文献