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本研究旨在分析不同体重苏姜猪的全基因组DNA甲基化差异，以期筛选出影响苏姜猪体重的差异甲基化基因（differentially methylated genes，DMGs）。利用全基因组重亚硫酸盐测序（whole genome bisulfite sequencing，WGBS）技术分析了3头180日龄高体重和3头180日龄低体重苏姜猪的全基因组DNA的甲基化程度、差异甲基化区域（differentially methylated regions，DMRs）和DMGs，对DMGs进行GO和KEGG分析，鉴别影响苏姜猪体重的候选基因。结果显示，苏姜猪全基因组范围内胞嘧啶（C）的平均甲基化率为4.1%，胞嘧啶（C）甲基化平均98.41%发生在CG序列上，CG序列环境下外显子、内含子和3'UTR的甲基化水平高于启动子和5'UTR。本研究共检测出1 657个DMRs和575个DMGs，8号染色体上DMRs分布最多，88.89%的DMRs的长度在500 bp以内，62.78%的DMRs分布在远端基因间区，98个DMGs显著富集于TOR信号的负调控、碳水化合物衍生物分解代谢过程、脂肪细胞因子信号通路、FoxO信号通路等53个GO条目和29个信号通路，鉴别到5个与苏姜猪体重相关的候选基因：瘦素受体（leptin receptor，LEPR）基因、肿瘤坏死因子受体相关因子6（tumor necrosis factor receptor associated factor 6，TRAF6）基因、生肌因子6（myogenic factor 6，MYF6）基因、钙依赖性分泌激活因子2（calcium dependent secretion activator 2，CADPS2）基因和表皮生长因子（epidermal growth factor，EGF）基因。本研究利用WGBS绘制了高、低体重组苏姜猪的全基因组DNA甲基化图谱，为深入研究苏姜猪体重差异的分子机制奠定了基础。 相似文献
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