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【目的】分析不同性别湖羊早期定植肠道菌群情况,为深入研究其与机体健康状况之间的关系提供数据支持。【方法】采集48份(母羊31份和公羊17份)45日龄湖羊的粪便,提取基因组DNA,进行高通量测序,筛选有效序列和分类操作单元(operational taxonomic units,OTUs),分析不同性别湖羊肠道微生物多样性,并通过多级物种差异判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)、非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling analysis,NMDS)、短期注意/记忆优先(short-term attention/memory priority,STAMP)模型确定菌群在门水平和属水平上的具体差异。【结果】经高通量测序,母羊获得2 014个OTUs,公羊获得1 747个OTUs,二者共有1 637个OTUs。不同性别湖羊早期定植肠道菌群共注释到15个门、25个纲,62个目、118个科和317个属。不同性别湖羊早期定植肠道菌群在门水平和属水平均存在显著差异;在门水平上,厚壁菌门... 相似文献
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为了解河南地区鸡螨虫病中的常见感染种类，试验采集了河南10个地区阳性蛋鸡场样品，采用形态学鉴定及基于鸡皮刺螨的18 S rRNA基因序列进行PCR扩增。结果显示：新乡市、开封市、平顶山市等8个地区采集8个阳性鸡场的样品虫体呈椭圆形，前端有长的口器，后部稍宽，肛板呈圆三角形，符合鸡皮刺螨的形态特征；在新乡市原阳县和周口市商水县白寺镇采集2个阳性鸡场样品虫体细长，整体小于鸡皮刺螨，肛板位于腹部末端，呈泪滴状，符合林禽刺螨形态特征；河南地区流行的鸡皮刺螨与日本LC034951.1基因序列相似性达100%，林禽刺螨和法国的FN646503.1基因序列相似性达98.72%。表明鸡皮刺螨和林禽刺螨已经在河南省蛋鸡中出现感染和分布。 相似文献
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