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随着我国经济迅速发展和医疗需求不断增长,人医临床、宠物临床和畜牧养殖行业中抗菌药物的使用愈发频繁,导致病原菌耐药问题日趋严峻,造成公共卫生安全隐患。快速、准确的细菌耐药表型检测能够有效指导临床医生对感染性疾病的诊断和治疗,降低由经验用药和不合理用药引发的耐药风险。然而,现有检测技术耗时较长且操作繁琐,难以在临床中推广,种类单一的快速检测试剂等产品又无法满足临床的多元化需求。因而,亟需开发新的技术方法以提供快速鉴定细菌耐药表型的有效解决方案。细菌的组学信息中蕴含大量与细菌耐药表型相关的特征,从中快速、准确地挖掘相关信息能够为快速诊断和治疗提供帮助。机器学习模型在处理复杂结构数据方面有显著优势,在挖掘组学信息工作中展示巨大应用潜力。随着该领域的快速发展,机器学习方法有望为临床快速、准确地预测耐药表型提供技术支持,助力医生诊疗准确性的提升。本综述系统总结了机器学习模型在细菌耐药表型预测领域的研究现状和发展趋势,并比较了不同机器学习方法的特点和性能,同时归纳总结细菌耐药表型预测建模工作所需的关键要素,为后续相关研究提供参考。 相似文献
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为研究宠物犬源blaCTX-M基因阳性肺炎克雷伯菌的携带情况，同时了解宠物犬携带blaCTX-M基因肺炎克雷伯菌的耐药表型和分子特征，本研究从355只宠物犬的鼻拭子和肛拭子中分离头孢噻肟耐药细菌，通过16S rDNA和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定细菌种属。对鉴定为肺炎克雷伯菌的菌株，运用PCR检测blaCTX-M基因，药物敏感性试验测定blaCTX-M基因阳性肺炎克雷伯菌的耐药表型，PFGE分型和全基因组测序技术分析blaCTX-M基因阳性肺炎克雷伯菌的分子特征。PCR结果显示，共分离到7株blaCTX-M基因阳性肺炎克雷伯菌，3株来自宠物肛拭子，4株来自宠物鼻拭子；药敏试验结果显示，7株菌均对头孢噻呋、头孢噻肟和阿莫西林-克拉维酸耐药，但对多黏菌素E、美罗培南和替加环素敏感。PFGE结果显示，其中3株细菌相似度为100%，而另外4株细菌相似度差异较大（<30%）。全基因组结果显示，7株菌共有5个ST分型，blaCTX-M基因分离的亚型为CTX-M-14型（n=5）和CTX-M-3型（n=2），同时这些菌株中还携带了其他β-内酰胺类、氨基糖苷类和氟喹诺酮类耐药基因。从本研究结果可以看出，目前宠物犬源blaCTX-M基因阳性肺炎克雷伯菌的检出率较低，但其多重耐药性较严重，本研究分离的耐药基因blaCTX-M、blaSHV亚型与国内外流行有差异。目前宠物在抗生素的使用和监控上仍有不足，需进一步关注宠物细菌耐药性，为后续防控提供依据。 相似文献
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为了解北京地区消毒剂抗性基因分布、携带情况及其与耐药基因之间的关系,本试验采集北京市6个行政区共计39家超市及农贸市场的猪肉和鸡肉样品,分离培养沙门菌并进行鉴定,随后结合Seqsero2、Staramr和Diamond等生物信息学软件对沙门菌的消毒剂抗性基因和耐药基因进行筛选与分析。结果显示,从28家超市和11家农贸市场的148份猪源和147份鸡源样品中共分离得到79株(26.78%)沙门菌。所有分离菌株共预测得到17种血清型,其中71株鉴定得到16种序列型(ST),大部分分离菌株的血清型与ST型一一对应,其中优势菌株为肠炎沙门菌ST11(n=24)。共检出32个消毒剂抗性基因,其中非共同携带的抗性基因有5个,包括外膜孔道蛋白基因opmD/npmC(携带率72.15%)、有机汞调控蛋白基因merR2(携带率37.97%)、季铵盐类消毒剂抗性基因qacEΔ1(携带率21.52%)和qacF(携带率12.66%)、外排泵基因oqxAB(携带率1.27%)。共检测出50个耐药基因,覆盖氨基糖苷类、大环内酯类和四环素类等共10类抗菌药物,其中氨基糖苷类占比最高(36.00%)。相关性分析结果显... 相似文献
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