奶牛乳房炎相关IRF5基因CDS区克隆及表达分析     

闫涛涛  姚婷婷  王正兴  马楠  蓝贤勇  周力  王兴平  罗仍卓么 《西南农业学报》2023,(5):1097-1104

【目的】研究奶牛干扰素调节因子5(Interferon regulatory factor 5,IRF5)基因在奶牛乳腺组织及乳腺上皮细胞炎症中的表达模式。【方法】利用RT-PCR和测序技术克隆得到IRF5基因的编码区(Coding sequence, CDS)序列,并采用生物信息学方法分析IRF5基因及其特性;利用qPCR技术检测IRF5基因及相关干扰素调节因子3(Interferon regulatory factor 3,IRF3)和MyD88基因的表达量。【结果】IRF5基因的CDS长度为1500 bp,编码499个氨基酸,存在47个潜在磷酸化位点,氨基酸组成中脯氨酸(Pro)和亮氨酸(Leu)所占比例较高。IRF5蛋白分子式为C₂₅₂₄H₃₉₀₁N₆₇₁O₇₂₈S₂₀,主要存在于细胞核和线粒体,理论等电点为5.38,是碱性亲水且不稳定的非分泌蛋白。蛋白互作分析结果显示,IRF5蛋白可能与骨髓分化初级反应蛋白(MyD88)、白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)、C...  相似文献   

基于Web of Science和CNKI数据库的奶牛乳房炎研究文献计量分析     

闫涛涛  姚婷婷  王正兴  马楠  蓝贤勇  王兴平  罗仍卓么 《黑龙江畜牧兽医》2022,(24):14-23+134-135

为了解奶牛乳房炎的研究进展,笔者分别以Web of Science核心合集数据库和中国期刊全文数据库(CNKI)为数据来源,对1992—2021年奶牛乳房炎研究外文文献发表量、发表国家、发表机构、作者、期刊、热门学科、关键词,以及中文文献发表量、发表机构、作者、期刊、关键词和基金项目进行计量分析。结果表明：奶牛乳房炎研究从1999年开始有外文文献记录,发表量整体呈上升趋势;美国的文献发表量一直领先,中国、德国、巴西和加拿大的文献发表量也较多。在外文文献发表量排名前20位的全球机构中,多数机构来自于欧美国家,康奈尔大学、圭尔夫大学和法国国家农业食品与环境研究院分别位居世界第1,2,3位;中国农业科学院位居世界第14位;外文文献发表量排名前3位的国内机构依次是中国农业科学院、中国农业大学和西北农林科技大学。外文文献发表量排名前10位的作者大多来自于欧美国家的高校,H.W. Barkema、Y.H. Schukken和S.De Vliegher在该领域具有较高的国际影响力;排名前10位的中国作者大多来自中国农业大学和山东省农业科学院,Han B.、Zhang Y.、Gao J.为排名前3位的...  相似文献