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肌内脂肪含量及脂肪酸组成是影响猪肉品质的重要因素,本研究旨在从基因表达水平分析相关关键基因的表达特征。本研究以大白猪和马身猪为研究对象,采用qRT-PCR技术检测ATP 5A 1、NDUFAB 1、CPOX、NDUFB 7、NDUFV 1和PSTPIP 2在不同日龄以及不同组织中的表达规律,采用MEGA7.0软件进行物种进化树分析。结果显示,6个基因在不同日龄的马身猪和大白猪上均有表达,但随着日龄增长,基因的表达趋势不同。在马身猪中,ATP 5A 1、NDUFAB 1、CPOX和NDUFB 7的表达量均随着日龄增长逐渐降低,PSTPIP 2表达量随着日龄增长出现先升高后降低的趋势,NDUFV 1表达量随着日龄增长没有显著变化。在大白猪中,ATP 5A 1和NDUFV 1表达量随着日龄增长逐渐降低,NDUFAB 1、CPOX和NDUFB 7随着日龄增长出现先降低后升高的趋势,而PSTPIP 2表达量随着日龄增长逐渐升高。组织表达谱发现,6个基因在脂肪的相对表达量极显著高于其他组织,另外,其在7种组织的相对表达量趋势不同。亲缘关系与进化树分析显示,6个基因在进化过程中比较保守。本研究结果可为进一步探讨猪肌肉脂肪酸代谢作用机制提供参考依据。 相似文献
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为了系统研究DDX解旋酶家族成员在猪生长发育中的作用，试验采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR检验技术，对猪DDX家族的42个成员的基因结构、理化性质、功能结构域、聚类进化树、GO功能，以及在大白猪和马身猪盲肠组织中的表达情况进行了研究。结果表明：猪DDX家族除DDX28和DDX53基因没有内含子外，其他成员均含有外显子和内含子，且外显子平均数量为16个，内含子平均数量为15个。除8号染色体外，其他染色体上均有猪DDX家族成员分布。该家族成员均为疏水蛋白并且大多数不稳定，具有多个亚细胞定位，整体来看主要分布于细胞核中。猪DDX家族成员共预测到了15个保守基序，其中DDX1、DDX11、DDX19B、DDX26、DDX36、DDX39A、DDX58和DDX60基因缺失D-E-A-D保守基序，有10个保守基序出现在超过30个成员的序列中，同时不同成员有相同的基序类型和特定的基序排列顺序。聚类分析将猪DDX家族42个成员分为6大簇，其中DDX2和DDX48、DDX21和DDX50、DDX43和DDX53、DDX5和DDX17具有高度同源性，支持率为100%。该家族大多数成员具有ATP依赖性... 相似文献
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