牛SLC13家族基因编码蛋白的生物信息学分析     

黄明捷  张勇  陈祥  陈伟  莫先艇  郭勇  王天松 《河南农业科学》2020,49(3):157-166

为研究牛溶质载体13(SLC13)基因编码蛋白的结构和功能,运用生物信息学软件对牛SLC13蛋白的理化性质、疏水性、二级结构及三级结构、序列保守基序、亚细胞定位、跨膜区进行分析,预测其蛋白质互作网络并构建不同物种SLC13基因家族编码蛋白的系统发育树。结果表明,牛SLC13蛋白的氨基酸数介于520～626个,亮氨酸含量最高,组氨酸含量最低,分子质量介于57.80～68.96 ku,其编码蛋白均为疏水性蛋白,除SLC13A2蛋白外的4个编码蛋白均为稳定蛋白。牛SLC13蛋白的二级结构主要由α-螺旋、β-转角以及无规卷曲组成,外显子数目介于11～16,除SLC13A3基因编码蛋白无Motif 10、SLC13A5基因编码蛋白无Motif 8外,其他编码蛋白序列均存在Motif 1—10,SLC13蛋白亚细胞定位于质膜、内质网和线粒体,SLC13A3蛋白在高尔基体中有少量分布。牛SLC13蛋白均为多次跨膜螺旋的内在膜蛋白,其以不同形式在生物学层面和分子功能层面发挥功能。系统进化分析发现,14个物种的SLC13A1、SLC13A4蛋白处于同一个较大分支,SLC13A2、SLC13A3和SLC13A5处于另一个较大分支,普通牛均与瘤牛、水牛、牦牛亲缘关系最近。  相似文献   

调控牛CEBPA基因表达的miRNA筛选及对肌内前体脂肪细胞增殖和分化的影响     

黄明捷  陈祥  张勇  陈伟  李俊  陆静  张雄  何琦  吴雨 《畜牧兽医学报》2021,52(1):52-65

旨在筛选并验证调控牛增强子结合蛋白A(CCAAT/enhancer binding protein alpha,CEBPA)表达的miRNA及其对肌内前体脂肪细胞增殖和分化的影响.本研究综合运用多个在线软件筛选与CEBPA基因具有潜在调控关系的miRNA,运用qRT-PCR技术检测CEBPA基因在关岭牛各类组织中的表达...  相似文献   

黔东南州生态畜牧业发展现状及建议     

黄明捷  陈敏  刘霜云  盘祖香 《农技服务》2023,(2):101-103

发展生态畜牧业是黔东南州从产业振兴维度有力推进乡村振兴事业的重要发力点。为推动黔东南州生态畜牧业健康可持续发展提供参考，总结黔东南州生态畜牧业在养殖规模化和标准化、屠宰加工体系、畜禽粪污资源化利用、地方特色畜禽种质资源保护方面取得的发展成效，指出产业发展中存在发展资金缺乏、畜禽良种供应不足、科技支撑力薄弱、产品加工程度低等问题，提出坚持市场导向与加强政府引导、坚持全局谋划和特色化发展、加强经营主体培育、加大产学研用深度融合等发展建议。  相似文献