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为了解养殖水低pH值对罗非鱼肠道菌群结构的影响,试验将36尾驯化后的吉富罗非鱼随机分为两组(空白组和处理组),每组3个重复,每个重复6尾,空白组养殖水pH值≈7.0,处理组养殖水pH值≈4.0,试验期为14 d,试验结束后提取两组肠道微生物基因组DNA,扩增16S rDNA基因,利用Illumina Miseq PE300平台进行测序后,对两组的肠道菌群的Alpha多样性指数、物种组成及优势菌群和差异菌群进行分析,并进行PICRUSt2功能预测和BugBase表型预测。结果表明：处理组肠道微生物的香农指数显著高于空白组(P<0.05),辛普森指数显著低于空白组(P<0.05),群落丰富度指数两组间差异不显著(P>0.05)。空白组和处理组肠道中菌门数量分别为22个和28个,共有的菌门数为18个;空白组和处理组肠道中菌属数量分别为235个和373个,共有的菌属数为137个;空白组和处理组肠道中扩增子序列变体(amplicon sequence variants, ASVs)数量分别为458个和791个,共有的ASVs数量为162个。在门水平上,处理组和空白组的优势菌群均... 相似文献
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