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以18种秋海棠属植物为试材,基于叶绿体ndhA基因内含子片段,利用Codon Code Aligner软件拼接序列后,通过MEGA软件进行比对并计算19个秋海棠属植物种间及种内遗传距离,最后利用邻接法构建分子系统树,研究了该片段作为DNA条形码对秋海棠属植物进行物种鉴定的可行性。结果表明:秋海棠属19个种类共59个个体的ndhA基因内含子序列长度为1 182bp,在所考察的候选秋海棠属植物中具有最大的种间变异和较小的种内变异,且二者存在极显著差异。在系统树中,秋海棠属植物每一物种能够分别形成各自独立的分支,表现出良好单系性。基于ndhA基因内含子的DNA条形码在识别秋海棠属植物物种方面和传统形态学基本一致。该研究表明,以ndhA基因内含子作为秋海棠属植物DNA条形码进行物种鉴定具有一定的可行性。 相似文献
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以来自14个地区(11个省份)的87个家系营造的种源/家系林为主要研究对象,通过观测统计3 a生树高、胸径、枝下高、干形、冠幅与保存率等性状选择优良家系,再以广东地区3片试验林共有的27个家系为研究对象分析地点间稳定性。结果表明:除干形在种源间、保存率在区组与种源的交互项上无显著差异,其余各性状在区组间、种源间、家系间及互作效应上均存在显著或极显著差异,其中树高、胸径、枝下高、干形的差异主要来自种源内家系与区组互作项,冠幅和保存率的差异主要来自区组。树高与胸径的相关性较大,且均与形质性状存在一定相关性;地理变异趋势为采种点由南到北,苦楝生长变慢,且低海拔种源的保存率更高;气候生态学基础变异趋势为来自水热条件好,日照较少地区的种源生物量更大。主要性状育种值的排序选优与综合指数的排序选优结果较为一致,JX38、JX29、GD46、QZ08、GD45、HUN31、JX25、GD37、GD38与QZ03入选为优良家系,适宜在粤中地区推广种植;速生稳定型包括GD28、HAN15、HAN17、HAN3等家系,因具有较快的生长速度与良好的遗传稳定性而值得进一步关注。 相似文献
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[目的]优化大旗瓣凤仙ISSR-PCR反应体系,为大旗瓣凤仙遗传多样性分析提供技术参考.[方法]利用正交试验设计对大旗瓣凤仙ISSR-PCR反应体系的5个因素(Mg2+、dNTP、引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA)4水平进行优化分析,并在此基础上对PCR反应过程中的退火温度进行筛选.[结果]建立了大旗瓣凤仙ISSR-PCR的优化反应体系,即在25.0 μL反应体系中含1×PCR Buffer、Mg+ 1.5 mmol/L、dNTP 0.25 mmol/L、引物0.8 μmol/L、TaqDNA聚合酶0.75~1.00 U、模板DNA 100 ng.通过该体系可以筛选出6条对大旗瓣凤仙种群扩增效果较好的引物.[结论]优化的ISSR-PCR反应体系具有较高的稳定性,可用于大旗瓣凤仙及凤仙属植物种群的ISSR遗传多样性分析. 相似文献
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以30个茶花品种为试材,采用5因素4水平正交实验以及单因素优化试验方法,研究Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR指纹图谱条带清晰度的影响,以进行茶花品种ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选。结果表明:茶花品种ISSR-PCR最适扩增条件为25μL反应体系中,Mg2+3.0mmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、引物0.3mmol/L、Taq DNA聚合酶0.5U、模板DNA 80ng以及52.1℃退火温度;试验从100个ISSR引物中筛选出12个适用引物;并对12个ISSR引物的多态性和稳定性进行了检验。 相似文献
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