基于EST-SSR标记的怀地黄遗传特性     

董瑞瑞  董诚明  申鹏龙  余孟娟  王鑫源  张岩岩 《北方园艺》2021,(15):119-125

以怀地黄新品种"怀中1号"和道地产区5个主流品种"金九""怀丰""北京3号""沁怀""85-5"共60个样本为试材,采用EST-SSR分子标记方法,研究不同怀地黄品种间遗传特性,以期为分子标记辅助育种提供参考依据.结果表明:从68对引物中筛选出9对具有多态性的引物,每对引物R检测到的等位基因数8～25个,平均15个.共检测到137个等位基因(分子量变异范围为100～500 bp),多态位点百分率97.08％.SSR多态信息量(PIC)分布范围为0.850 1～0.926 4,平均为0.900 7.有效等位基因1.153 1～1.201 2,Nei's 基因多样性为0.085 7～0.111 3,Shannon 指数为0.124 6～0.160 5,不同品种的遗传距离范围0.148 6～0.590 9.聚类分析结果显示,遗传相似系数为0.59时,6个品种分为3类,在遗传相似系数0.79处,每个品种的10个样本单独聚为一类.表明SSR分子标记可以用于地黄不同品种之间的亲缘关系鉴定以及品种纯度的验证.  相似文献   

不同产地连翘EST-SSR标记遗传多样性研究     

申鹏龙  董诚明  夏伟  李曼 《北方园艺》2019,(13):140-147

以采自连翘主产区河南和山西12个产地的77份连翘种质资源为试材,采用EST-SSR分子标记技术分析其遗传多样性,以期探索不同产地连翘的遗传相似性以及其关键影响因素。结果表明:从60对引物中筛选出14对扩增条带清晰,稳定性好的多态性EST-SSR引物,14对引物在77份样品中共扩增出370条带,多态性条带368条,多态位点百分率为99.46%,12个产地的遗传距离范围是0.020 3~0.092 2,平均遗传距离为0.055 8。根据遗传相似系数对12个产地进行聚类分析,在0.935处把12个居群聚为5类;同时对77份样品进行聚类分析,在0.72处把77份样品聚为5类,个体聚类结果与产地聚类结果相似。聚类结果分析表明,连翘的遗传相似性与地理距离没有显著的相关性,主要与生长环境以及海拔等因素有关。试验结果揭示了不同产地连翘遗传相似度的关键因素,为连翘亲缘关系的鉴定、连翘资源的保护与开发奠定了基础。  相似文献