松材线虫热激蛋白家族成员结构与功能分析          下载免费PDF全文

郝昕  邓振  陈洁  刁健  李洋  王欣然  马玲 《中国生物防治学报》2022,38(3):774-784

热激蛋白（Heat Shock Proteins,HSPs）是一类广泛存在于细菌、真菌和动植物中的热应激蛋白质。本研究从松材线虫基因组中获取了23个与秀丽线虫HSPs基因家族同源的Bx-HSPs家族基因。随后对这些基因所编码的蛋白质二级结构、疏水性、蛋白质序列基序和三级结构等生物学特性进行了预测。结果表明了Bx-HSPs家族成员的分子伴侣特性。本研究为松材线虫应激生理学及研究松材线虫适生范围和风险分析提供了分子生物学理论基础。  相似文献   

PGP基因家族成员的结构和功能     

李洋  刁健  郝昕  马玲 《东北林业大学学报》2021,49(3):126-131

通过对松材线虫耐药基因家族成员Bx-pgps的基因和蛋白质结构与功能的分析,对该家族成员的耐药机制进行了分析预测。从松材线虫基因组数据库中获得了与秀丽线虫pgp基因家族成员同源的基因,分别命名为Bx-pgp1至Bx-pgp10。对其疏水性、跨膜区域和拓扑异构结构等生物学特性进行了预测。结果表明:Bx-PGPs家族成员可能具有跨膜运输功能。  相似文献   

松材线虫P糖蛋白在药物代谢过程中的功能研究     

李洋  郝昕  李明锐  刁健  马玲 《北京林业大学学报》2021,43(11):71-78

  目的  探究松材线虫对药物敏感能力产生的分子机制，为防治松材线虫提供理论基础。  方法  本研究从松材线虫基因组中获得秀丽线虫同源解毒基因Bx-pgp23，并对该基因蛋白编码区进行PCR扩增，随后通过生物信息学对蛋白质Bx-PGP23理化性质、亲疏水性、跨膜区分布、磷酸化位点、二级结构和三级结构进行了分析和预测。并通过RNAi技术对Bx-pgp23进行沉默处理，分析Bx-pgp23沉默与否对松材线虫药物敏感程度的影响。  结果  生物信息预测结果显示PGP蛋白稳定系数为38.31，亲水系数为?0.018，三级结构预测PGP蛋白具有多个氨基酸参与构成α螺旋和β折叠并且具有多个核苷酸结合域和跨膜结构域。应用RNAi技术对Bx-pgp23基因进行基因沉默，沉默后的Bx-pgp23基因表达量变为原来的42.65%。药剂敏感性检测实验结果显示，在1.5和2.5 g/L苦参碱溶液处理24 h后，RNAi组松材线虫死亡率与对照组相比升高了7.2%和6.4%，在1.5和2.5 g/L的苦参碱溶液处理48 h后，RNAi组松材线虫死亡率与对照组相比升高9.0%和7.2%。  结论  蛋白质Bx-PGP23是一种稳定的亲水蛋白，具有跨膜外排功能。成功克隆Bx-pgp23基因并合成了该基因dsRNA。Bx-pgp23基因沉默影响了松材线虫对苦参碱的敏感性，在相同质量浓度的苦参碱胁迫下，RNAi组线虫死亡率明显高于对照组，说明Bx-pgp23基因在松材线虫药物代谢调控中发挥着正向调控作用。   相似文献   

解淀粉芽孢杆菌AW3诱导发病红松的抗病机制     

张平  刁健  王立海 《吉林农业大学学报》2024,(1):40-48

为探究植物根际促生菌（PGPR）解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefacien）AW3对尖孢镰刀菌（Fusarium oxysporum）侵染下红松（Pinus koraiensis）抗病的影响,在温室条件下,使用解淀粉芽孢杆菌AW3发酵液诱导发病红松幼苗,测定红松根腐病相对防治效果及可溶性蛋白、可溶性糖、苯丙氨酸氨解酶（PAL）、过氧化氢酶（CAT）、超氧化物歧化酶（SOD）和抗病相关基因等指标。结果表明：菌株AW3对红松根腐病的温室防效为79.3%,接种红松后,能诱导红松更迅速地产生细胞防卫反应,活性氧和细胞膜透性相对染色强度分别为对照组的2.57倍和2.98倍,差异显著（P<0.05）;红松幼苗体内可溶性糖和可溶性蛋白含量均显著增加,SOD、POD以及CAT酶的活力显著提高,并且诱导了茉莉酸、水杨酸和与生长素信号转导相关基因的转录。总之,在尖孢镰刀菌的侵染下,菌株AW3诱发了发病红松的抗病机制,在防御相关酶和抗病基因的综合作用下减缓了红松病害的发生。可见,菌株AW3是一种非常有效的细菌,可用于控制红松根腐病。  相似文献   

松材线虫黄素单加氧酶家族基因结构与表达模式分析     

郝昕  谭瑞娜  陈洁  李洋  曹景鑫  刁健  邓振  张平  马玲 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2023,(2):191-199

黄素单加氧酶（flavin-containing monooxygenases, FMOs）是一类广泛存在于植物、动物、微生物中，主要参与调控生物体对内源性及外源性物质代谢的生物酶家族。为探究松材线虫FMOs(Bursaphelenchus xylophilus FMOs, BxFMOs)在宿主中定殖和响应杀线剂胁迫过程中所发挥的功能，本研究首先通过生物信息学手段从松材线虫基因组中筛选并鉴定了13个BxFMOs家族基因，随后对获得的BxFMOs家族基因进行理化特性、进化发育、蛋白结构及基因表达模式分析。结果表明：BxFMOs家族成员分布于5条染色体上，氨基酸数目为432～572个，分子量为49.77～66.09 kDa，等电点为6.26～9.27，其结构较为保守。基因表达模式分析揭示，BxFMOs家族对松材线虫定殖和响应杀线剂胁迫具有显著影响。本研究对探索松材线虫在宿主中的定殖机制和寻求防治松材线虫分子靶标具有重要的指导意义和理论价值。  相似文献