基于转录组测序开发糜子SSR标记     

陈小红  何杰丽  石甜甜  邵欢欢  王海岗  陈凌  高志军  王瑞云  乔治军 《中国农业科学》2020,53(10):1940-1949

【目的】 以6份不同地理来源的糜子资源为试验材料,基于前期转录组测序获得的1 000对SSR引物,选出200对进行多态性检测,以期构建一批可以准确评估糜子种质遗传差异的分子标记。【方法】 用Primer Premier 5.0软件设计引物,改良CTAB法提取DNA,PCR扩增DNA和聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选引物多态性;用PowerMarker 3.25和PopGen 1.32计算遗传多样性参数。【结果】 200对引物中97对呈单态性,80对呈多态性。单碱基序列重复引物有20对,10对具多态性,其重复基元是A（50%）和T（50%）。二碱基序列重复引物有36对,15对具多态性,其碱基重复类型有7种（AG最多,TC、GC和GA次之,CA、TA和AC最少）。三碱基序列重复引物有144对,55对具多态性,其碱基重复类型有24种（GGC、GCG和GCC最多,GAA、GCT和CGC等次之,ACC、AGG、CAG、CGT、AAG、AAC、TCG、CGA、ATT、CAA和CCA最少）。就引物分辨率(Rp)值而言,1—3碱基序列重复引物分别为0.67—4.67（平均2.07）、1.33—4.33（平均2.73）和0.67—4.00（平均1.83）。基于Rp值分析SSR分布频次,发现80个标记分布在5个区间：0—1、1—2、2—3、3—4和4—5,分别包含17（21.25%）、36（45.00%）、11（13.75%）、14（17.50%）和2个（2.50%）。就$\overline{\text{Rp}}$值而言,1—3碱基序列重复引物分别为0.33—0.67（平均0.51）、0.40—0.78（平均0.59）和0.33—0.83（平均0.59）。单碱基序列重复标记共检测到22个等位变异,每个位点为2—3个（平均2.2000）,其中8个和2个位点分别具2和3个变异;二碱基序列重复标记共检测到38个等位变异,每个位点为2—3个（平均2.5333）,其中7个和8个位点分别具2和3个变异;三碱基重复标记共检测到136个等位变异,每个位点为2—3个（平均2.4727）,其中29个和26个位点分别具2和3个变异。就多态性信息含量而言,1—3碱基序列重复引物分别为0.3750—0.5355（平均0.4293）、0.2392—0.7438（平均0.4293）和0.2392—0.7438（平均0.3989）。就多样性指数而言,1—3碱基序列重复分别为0.6365—1.0776（平均0.7497）、0.5623—1.0986（平均0.8339）和0.5623—1.0889（平均0.8312）。【结论】 基于转录组测序结果,检测200对SSR引物的多态性,发现177对（88.5%）可以扩增出完整条带,其中80对具多态性,多态率为40%。  相似文献   

荒漠-绿洲边缘区生态过渡带的土壤颗粒分形特征   总被引：3，自引：2，他引：3  

陈小红  段争虎  何洪泽 《土壤》2009,41(1):97-101

通过实地采样和实验室分析,测定了黑河中游荒漠绿洲边缘区生态过渡带的土壤粒级分布、有机碳(SOC)、全氮(TN)、全磷(TP)、速效氮(AN)和速效磷(AP)的含量,并采用1993年杨培岭等提出的用粒径的重量分布代替数量分布的土壤分形模型,计算了土壤颗粒分形维数;最后利用统计分析法,研究了颗粒分形维数与土壤粒级分布及各养分指标的关系.结果表明:从荒漠边缘向绿洲延伸的过渡带,土壤中砂粒含量占绝对优势,粉粒居中,黏粒最少,采样区土壤质地较粗;土壤颗粒分形维数在2.105～2.609之间变动,处于极低水平,与土壤各养分指标具有相似的变化趋势,除靠近绿洲区存在一个"生态裂谷"外,整体呈上升趋势;利用相关分析法得出,土壤颗粒分形维数与砂粒含量呈显著负相关,与黏粉粒及各养分指标均呈显著的正相关;利用回归分析法进行定量分析,砂粒含量每增加1g/kg,颗粒分形维数D降低0.0019个单位;粉粒和黏粒含量每增加1g/kg,颗粒分形维数D分别增加0.002和0,023个单位,对土壤颗粒分形维数变化幅度的影响依次为黏粒>粉粒>砂粒,分形维数对黏粒含量的变化最为敏感.因此,可以将土壤颗粒分形维数作为衡量荒漠-绿洲边缘区土壤养分变化状况的指标之一,用于反映荒漠绿洲区土壤的退化状况.  相似文献   

退耕坡地系统生态综合评价中几个景观生态学问题     

赵安玖  胡庭兴  陈小红  李臣 《四川林业科技》2006,27(6):80-86,68

退耕坡地系统属于退化土地生态系统,大部分是毁林(草)开荒形成的,是人为加速了自然生态系统的逆行演替而形成的低产脆弱的生态系统。对退化生态系统进行综合整治与恢复,以及人工生态系统的重建的理论基础是生态演替和人为设计理论。退耕还林(草)是通过一定的社会物质和能量的投入定向加速景观生态系统的演替过程。评价退耕地的生态经济效益是退耕还林(草)工程的重要组成部分,重点评定项目是否实现预期目标、项目的产出、效果和影响。本文应用景观生态学的理论:景观尺度与等级理论、景观空间格局与异质性理论、景观演化与干扰理论探讨了退耕地生态评价的内容、方法和应注意的问题,从而为退耕还林(草)工程的顺利进行提供有力的保障。  相似文献   

节水灌溉经济分析中几个问题的探讨   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈小红  王立宏  吴涤非 《节水灌溉》2007,(1):76-77

对节水灌溉经济效益分析中,经常遇到的经济效益计算问题和工程折旧费问题进行了探讨.指出比较科学合理的节水经济效益计算方法或者是采用直接计算法,或者是采用"一次转移"法,并提出了折旧费"提取"的方法和建议.  相似文献   

闽西常绿阔叶林群落特征分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

孔祥海  黄素华  陈小红  邱丰艳 《福建林学院学报》2009,29(4)

采用群落生态学的方法对闽西常绿阔叶林植被的1.6 hm2样地调查统计、分析,结果表明,构成闽西常绿阔叶林群落的优势科是樟科、壳斗科、木兰科、紫金牛科和山茶科等;闽西常绿阔叶林群落的植物区系具有明显的热带、亚热带地理性质;闽西常绿阔叶林群落的建群树种多,且部分不同的建群种间可组合构成不同的群丛,群落类型呈现多样化;闽西常绿阔叶林群落的外貌以单叶、革质、全缘和中小型叶为主的常绿中、小高位芽植物组成为特征;闽西常绿阔叶林群落植物在物种组成数量、科属分布区类型和生活型谱以及叶的性质特征等方面具有中亚热带南部向南亚热带过渡的特点。  相似文献   

陇中兰州地区厚层灌淤土研究概况     

陈小红  何春雨 《勤云标准版测试》2007,(11):50-51

就分布于陇中兰州地区的灌淤土分类和特征作了简要的概述,对具有典型代表性的厚层灌淤土的特征特性、理化性质、剖面结构、形成原因、土壤养分、盐分分布规律、机械组成作了详细的阐述,以达到对该类土壤开发利用的指导作用,避免由于盲目使用造成的经济和生态方面的负面效应。同时对本土属中的红吃劲土也作了精要的介绍,为该土壤的开发利用提供科学依据。  相似文献   

对农业规模经营内涵的再认识     

陈小红  陈浩 《陕西农业科学》2001,(10):27-28,31

农业规模经营是继家庭承包责任制后我国农业的又一重大改革.通过走规模化道路,充分发挥规模优势,有利于实现农业生产的集约化和现代化,从而提高农业的综合效益.然而,各地在探索农业规模经营的过程中,由于缺乏对其科学内涵的全面正确认识,往往局限在土地规模等狭义生产要素上做文章,不仅影响了农业规模优势的发挥,甚至效果适得其反.本文试就规模农业的内涵作一浅析.……  相似文献   

4%异丙威WP防治水稻飞虱的效果   总被引：3，自引：0，他引：3  

陈小红 《农技服务》2012,(3):301

进行了4%异丙威WP防治水稻飞虱田间药效试验。结果表明:4%异丙威粉剂防治稻飞虱效果很好,对水稻非常安全,对其他生物无明显影响,很有推广前途,4%异丙威粉剂防治水稻飞虱推荐量为15～18 kg/hm2,可达到防治效果。  相似文献   

百香果果皮主要有效成分连续提取工艺     

陈雪梅  刘夏蕾  林标声  陈小红  黎英 《热带作物学报》2023,(2):405-418

百香果是西番莲科西番莲属的芳香热带水果,其果皮约占鲜果的55%,富含膳食纤维、维生素、花色苷及果胶等多种有效成分,加强对百香果皮的产业化利用具有重要的环境价值和商业潜力。为充分利用百香果皮资源,提高百香果皮有效成分的利用率,先后采用微波辅助、超声波辅助和微生物发酵技术,从百香果皮中提取果胶、花色苷和膳食纤维等有效成分,通过单因素试验和响应面分析对提取过程的各阶段关键环节进行优化。结果表明：百香果果皮中果胶最佳提取条件为液料比65∶1(mL/g)、pH 2.5、微波功率450 W、微波时间5.0 min;从提取果胶后的滤渣中提取花色苷的最佳提取条件为乙醇浓度50%,液料比60∶1(mL/g),pH 3.5,超声功率550 W,超声时间35 min;从提取果胶和花色苷后的百香果皮渣中提取膳食纤维最佳提取条件为液料比12.5∶1(mL/g),接种量5.0%,发酵温度35℃,发酵时间20 h,在此工艺条件下,百香果皮中果胶、花色苷和膳食纤维的得率分别为12.45%±0.06%、1.21%±0.03%和55.56%±0.05%。联产工艺中,花色苷、膳食纤维的得率虽然与单产相比分别减少了15.39...  相似文献   

三倍体福建牡蛎生长、育肥与海洋环境因子的关系          下载免费PDF全文

许翠娅  杨芳  郑盛华  祁剑飞  陈小红  魏姗姗  林永青  席英玉  林琪 《上海海洋大学学报》2024,33(3)

为探究影响三倍体福建牡蛎(Crassostrea angulata)生长、育肥的关键海洋环境因子,对黄岐湾三倍体福建牡蛎养殖区开展为期10个月的调查,获得湾外和湾内养殖区牡蛎生长指标和海洋环境因子数据,并采用冗余分析(RDA)等方法进行数据分析。结果表明：牡蛎壳长、壳宽、全重、软体组织湿重、出肉率等生长指标湾内外组间差异显著,均为湾外显著大于湾内(P<0.05),壳高则湾内外差异不显著(P＞0.05);湾外海水中硝酸氮、叶绿素-a含量、浮游植物细胞密度显著高于湾内(P<0.05),其余指标湾内外无显著差异(P＞0.05)。RDA分析结果显示,影响牡蛎生长指标的主要因子是水温、硝酸氮、浮游植物细胞密度和化学需氧量,浮游植物细胞密度和叶绿素-a含量对牡蛎出肉率影响作用最大。综合分析认为,水温、浮游植物生物量、营养盐是影响三倍体牡蛎生长、育肥的关键海洋环境因子,春季至初夏至少有1个月时间海区平均叶绿素-a含量在6 μg/L以上有利于牡蛎育肥。本研究可为三倍体牡蛎健康养殖、品质提升和养殖海区的选择提供科学依据。  相似文献