长顺绿壳蛋鸡SFRP5基因外显子1的SNPs鉴定及其与常规肌肉品质的关联性分析     

游敏芳  廖朝美  吴磊  张依裕  刘若余  蒋会梅  张义玲  向程举  杨远清 《畜牧与兽医》2021,(3):1-6

分泌型卷曲相关蛋白-5(SFRP5)对畜禽脂质代谢起着至关重要的调控作用.为了探讨鸡SFRP5基因SNPs与肌肉品质的相关性,采用PCR产物直接测序法检测SFRP5基因外显子1的SNPs位点,分析其对长顺绿壳蛋鸡胸肌肌肉品质的影响.结果显示:在SFRP5基因外显子1的CDS区中发现3个SNP沉默突变位点:g.23251...  相似文献   

三穗鸭SLC4A9基因表达量及其多态性对蛋壳品质的遗传效应分析     

杨酸  张依裕  谭元成  王盈童  游敏芳  廖朝美 《中国畜牧兽医》2021,48(6):2082-2090

为探究溶质载体家族4成员9（solute carrier family 4 member 9,SLC4A9）基因的表达量及其多态性对鸭蛋壳品质的遗传效应,试验采用实时荧光定量PCR法检测SLC4A9基因在三穗鸭不同组织中的表达水平,采用PCR产物直接测序法筛查三穗鸭SLC4A9基因的SNP位点,并分析SNP位点对三穗鸭蛋壳品质的遗传效应。结果显示,SLC4A9基因mRNA在三穗鸭10个组织中均有不同程度表达,其中在心脏和胰腺中为高度特异性表达,肾脏中为中度表达,其他为低度表达。试验共检测到10个SNPs位点,其中3个位于外显子上（g.6803 C>T、g.7065 C>T和g.7089 C>G）,且均为错义突变,7个位于内含子上（g.7162 C>G、g.11044 G>A、g.11090 T>C、g.11234 C>T、g.11261 C>T、g.11349 C>T和g.11403 G>A）,其中g.6803 C>T位点突变导致丙氨酸（GCG）变为缬氨酸（GTG）;g.7065 C>T位点突变导致丙氨酸（GCC）变为缬氨酸（GTC）;g.7089 C>G位点突变导致丙氨酸（GCA）变为甘氨酸（GGA）。χ²检验结果显示,g.6803 C>T、g.11090 T>C和g.11349 C>T突变位点的基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡状态（P<0.05）,其余位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。关联分析结果表明,g.11349 C>T位点的CC和CT基因型蛋壳强度显著高于TT基因型（P<0.05）。综上,SLC4A9基因的10个SNPs位点均对三穗鸭的蛋壳品质产生影响,其中g.11349 C>T位点达到了显著水平,可为蛋鸭蛋壳品质的改善及遗传标记提供参考依据。  相似文献   

长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR 结构域的多态性对蛋壳品质的影响     

游敏芳  吴磊  廖朝美  张依裕  刘若余  谭光辉  李杰章 《河南农业科学》2020,49(8):124-129

为了探究贵州特产长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域的多态性对蛋壳品质的影响,采用在线引物设计软件Primer Premier 3.0设计1对引物,扩增ITPR1基因RYDR-ITPR结构域,利用双向直接测序和序列比对法挖掘单核苷酸多态性(SNP)位点,应用SPSS 18.0软件分析SNP位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响。结果显示,在ITPR1基因第17～19内含子区共发现3个SNP位点,分别为位于18内含子上的g.18853584 GT、g.18853600 AG突变位点和19外显子上的g.18853848 CT突变位点;3个SNP位点均为中度多态,均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P0.05),共检测到4种单倍型和7种双倍型。关联分析结果显示,位于19外显子上的g.18853848 CT突变对蛋壳厚度有显著影响,TT、CC基因型显著高于TC基因型(P0.05);双倍型H3H3的蛋壳厚度和蛋壳强度测定值最高。综上,长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域中g.18853848 CT突变可能是影响蛋壳厚度的标记位点,双倍型H3H3可能是蛋壳厚度和蛋壳强度的有利双倍型。  相似文献   

三穗鸭PRKCB基因内含子14的变异对蛋壳品质的影响     

廖朝美  游敏芳  谭光辉  李杰章  张依裕  覃媛钰  刘若余 《浙江农业学报》2020,32(9):1574

为探究PRKCB基因对三穗鸭蛋壳品质的遗传效应,采用PCR产物直接测序法、DNAStar软件MegaAlign程序结合Chromas软件对120只三穗鸭(Anas platyrhyncha domestica)PRKCB基因的遗传位点变异进行筛查鉴定,用SPSS 18.0软件分析SNP位点与蛋壳品质的相关性。结果显示:在三穗鸭PRKCB基因第14内含子检测到g.1158465 C>T、g.1158519 G>A和g.1158524 G>A这3个SNPs突变位点,每个突变位点均产生3种基因型,且均为中度多态位点。g.1158519 G>A和g.1158524 G>A突变位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,g.1158465 C>T位点的基因型分布则显著(P<0.05)偏离Hardy-Weinberg平衡;g.1158519 G>A和g.1158465 C>T位点之间存在强连锁不平衡。3个SNPs共组成5种单倍型和8种双倍型,优势单倍型H5(TGG)的频率为0.492,优势双倍型H2H5频率为0.200。关联分析显示,g.1158519 G>A位点的AG基因型个体蛋壳厚度显著(P<0.05)高于GG基因型个体,双倍型H1H3个体的蛋壳厚度显著(P<0.05)高于H3H5个体的蛋壳厚度。研究结果提示,PRKCB基因的遗传变异可以影响蛋壳品质,其中g.1158519 G>A位点可作为改善三穗鸭蛋壳品质选择的遗传标记。  相似文献   

鸭TRPV6和SLC4A4基因SNPs对蛋壳品质的影响     

廖朝美  杨红  舒畅  叶丽  杨远青  张依裕  肖家洪 《中国畜牧杂志》2024,(5):154-161

试验旨在探究三穗鸭TRPV6基因和SLC4A4基因SNPs突变对蛋壳品质的影响,筛选出与蛋壳品质相关的分子标记。利用PCR扩增和直接测序法相结合的方法检测鸭TRPV6基因和SLC4A4基因的SNPs,并与蛋壳品质进行关联分析。结果显示：在TRPV6基因第2内含子发现的g.81465153 C>G和g.81465176A>G突变分别对蛋壳重和蛋重有显著影响,在第3外显子发现同义突变g.81465450 T>C;3个SNPs联合产生5种单倍型和7种双倍型,位点联合对蛋壳重有显著影响。在SLC4A4基因第24外显子发现同义突变位点g.15125097 C>T,在内含子25发现g.15132523 G>A突变对蛋形指数有极显著影响,在内含子26发现g.15135079G>A突变;3个SNPs联合产生4种单倍型和7种双倍型,位点联合对蛋壳重有极显著影响。2个基因聚合后6个SNPs联合产生8种单倍型和7种双倍型,位点联合对蛋壳重和蛋重均有显著影响。表明TRPV6基因和SLC4A4基因新发现的3个SNPs联合和2个基因的6个SNPs联合均对蛋重和蛋壳重有显著效应,...  相似文献   

OCX-32基因表达载体构建及其对鸡子宫上皮细胞Ca2+浓度和脂质指标的影响     

廖朝美  吴磊  游敏芳  谭光辉  李杰章  李万贵  张依裕 《中国畜牧兽医》2021,48(7):2324-2332

为探究卵黄蛋白原-32（ovocalyxin-32,OCX-32）基因过表达与鸡子宫上皮细胞Ca²⁺含量和脂质指标之间的关联性,本研究采用Ⅳ型胶原酶法分离培养长顺绿壳蛋鸡子宫上皮细胞,构建pcDNA3.1（+）+OCX-32+Flag表达载体并转染子宫上皮细胞,测定OCX-32基因过表达量、Ca²⁺浓度和脂质指标并进行相关性分析。结果显示,试验组的总胆固醇（TCHO）浓度显著高于对照组（P<0.05）,对照组的Ca²⁺浓度显著高于试验组（P<0.05）。OCX-32基因过表达量与Ca²⁺浓度呈显著负相关关系（P<0.05）,与甘油三酯（TG）浓度呈显著正相关关系（P<0.05）,与TCHO浓度呈极显著负相关关系（P<0.01）,TCHO浓度与TG浓度呈极显著负相关关系（P<0.01）,研究结果揭示了OCX-32基因过表达能够调控鸡子宫上皮细胞的Ca²⁺含量和脂质的合成转运,为深入阐释鸡子宫上皮细胞中脂质和钙分泌的调控机制提供试验基础和数据支持。  相似文献   

樱桃谷鸭IP3R3基因多态性与蛋壳品质的关联分析     

廖朝美  李杰章  游敏芳  谭光辉  张依裕 《河南农业科学》2021,50(6):142-148

为了探究三磷酸肌醇受体3型(IP3R3)基因多态位点对蛋鸭蛋壳品质的影响,试验以樱桃谷鸭为材料,收集45周龄鸭蛋测定蛋质量、蛋形指数、蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋壳质量5个指标,并与突变位点进行关联性分析.结果显示,在IP3R3基因中检测到2个SNP位点,分别为第6外显子的g.5539186 T>C突变和第8外显子的g.55...  相似文献