MicroRNA数字特征综述     

朱荣胜  刘景璐  陈庆山 《东北农业大学学报》2015,(2)

阐述MicroRNA（miRNA）数字特征在计算识别中的发展及应用,总结相关数字特征在miRNA基因及靶基因预测中的作用。miRNA数字特征是计算识别物种新miRNA基因的工具,从首个miRNA基因被发现以来,数字特征研究由最初的miRNA序列特征和二级结构特征到现在常用的热力学特征、熵特征和拓扑特征等,均被广泛应用于新miRNA基因鉴别和靶基因辨识。随着新一代测序技术广泛应用,miRNA数字特征在miRNA生源论探讨、基因和靶基因识别、生物合成途径发掘等研究中具有重要作用。文章提出将数字特征应用于靶基因功能的归属判别、生物进化等研究领域,为miRNA数字特征在其他研究领域应用提供参考和借鉴。  相似文献   

黑龙江省大豆品种单株粒重与其他农艺性状的灰色关联度分析   总被引：2，自引：1，他引：1  

胡振帮  朱荣胜  高运来  刘春燕  蒋洪蔚  韩冬伟  胡国华  陈庆山 《东北农业大学学报》2011,42(11):57-62

以黑龙江省13个育种单位覆盖6个积温带的132份品种为试验材料,采用灰色关联分析方法,对影响大豆单株粒重的主要农艺性状进行了分析.结果表明在与大豆单株粒重相关的农艺性状中,荚粒重、单株粒数和3粒英数的重要性排在了前三位,整体性状重要性的排序为:荚粒重＞单株粒数＞3粒英数＞2粒英数＞茎杆重＞4粒英数＞英皮厚＞1粒英数＞粒...  相似文献   

基于一种新测度的基因型分类方法研究     

朱荣胜  陈庆山  胡振帮  胡国华 《东北农业大学学报》2010,41(6)

提出一种了针对基因型数据的测度,重新设计了聚类分析,并根据新的聚类方法对真实数据进行分析。结果表明,基因型向量相似的个体倾向于表型值相近。这一测度的提出和结论的形成将为G-P模型的构建提供新的思路。  相似文献   

黑龙江省农机总动力趋势包络预测与分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

朱荣胜  王福林 《东北农业大学学报》2006,37(4):512-515

文中对趋势包络预测方法进行了详细介绍,并应用此方法,依据历年的数据对黑龙江省农机总动力进行了预测。预测结果与实际数据相对照表明,预测精度较高,这对黑龙江省农业机械发展规划有着重要意义,为规划提供了依据。  相似文献   

大豆表达序列标签(ESTs)研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

崔佳欣  孟军  朱荣胜 《东北农业大学学报》2009,40(2)

大豆是重要的粮油作物,研究大豆基因组结构与功能对于揭示大豆的遗传发育机理及培育高产优质大豆新品种具有重要意义。文章综述了近年来ESTs数据在基因图谱绘制、基因识别、发现SNPs等方面的研究。  相似文献   

东北地区大豆主栽品种油份蛋白含量的关联分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

齐照明  侯萌  韩雪  齐慧冬  蒋洪蔚  辛大伟  朱荣胜  胡振邦  刘春燕  胡国华  陈庆山 《中国油料作物学报》2014,36(2):168

为探寻与大豆油份含量、蛋白含量相关的关键位点,本研究选取中国东北地区92份大豆主栽品种及常用种质资源品种群体基于蛋白含量和油份含量的Meta分析,进行基于数学模型的类群划分评价,估测样本群体的结构,应用简单线性模型分析与大豆油份含量、蛋白含量相关的的位点。结果表明,通过多次迭代测试,当K=5时,即该资源群体可以分为5个亚群时,为最稳定的分类结果,并在显著水平下（p<0.05）,贡献率大于1%的标记中,得到与大豆油份含量相关标记有Sat_412,Sat_195,Satt317,Sat_187,Sat_195,Satt255,Satt713,Satt468,Satt267,Satt686,Sat_294和AZ302047,对油分含量的总贡献率为39.54%。蛋白质含量相关标记有Satt683,Sat_311,Satt578,Satt181,Satt317,Satt700,Satt713,Satt255,Sat_242和Satt720对蛋白质含量总贡献率为48.39%。这些重要的标记位点为大豆油份含量和蛋白含量的分子辅助育种提供重要基础。  相似文献   

基于语义分割的大豆主茎精准表型自动获取及其在导入系材料选择中的应用     

朱荣胜  李帅  闫学慧  闫壮壮  虞江林  石嘉  苏晓燕  曹阳杨  辛大伟  李杨  蒋洪蔚  赵振庆  张战国  陈庆山 《中国油料作物学报》2020,(1):61-70

大豆导入系群体的构建和材料的选择是大豆育种的重要手段之一,而针对某一具体表型的材料选择不仅能够提高育种效率,而且还能够加快定位目标性状基因的进程。本研究针对由绥农14(轮回亲本)和野生野生大豆ZYD00006(供体亲本)为双亲构建的导入系(190个个体),采用机器视觉中的语义分割技术,对主茎相关表型进行了自动提取,实验结果表明:此方法完全可以取代人工测量且具有良好的可移植性,同样可用于其他作物的表型获取。在此基础上,本研究针对大豆主茎相关表型,对参试材料进行系统聚类,结果明确给出各参试材料(近等材料)基于主茎表型的聚类情况。这一结果将成为针对主茎表型进行材料选择的重要依据,同时依据这一结果可以大大加快主茎相关表型基因的定位。  相似文献   

大豆油分含量位点主要等位基因挖掘   总被引：1，自引：0，他引：1  

吴琼  朱荣胜  齐照明  蒋洪蔚  杨春明  刘春燕  胡国华  陈庆山 《大豆科学》2012,31(4):542-545,551

应用241份国内外大豆资源和18个SSR引物,卡方检验及t检验鉴定出3个与大豆油分含量正向相关的重要位点,分别为Satt343,Sat₂95和Satt598,每一位点各含1个与油分相关的重要等位基因,分别为Satt343₃,Sat₂95₆和Satt598₇,这3个等位基因对油分含量呈正效应,并在分别在引物Satt343和Sat₂95附近发现已定位的与油分含量相关的基因。  相似文献   

大豆MIR156基因家族起源与进化模式研究     

朱荣胜  金会会  王志豪  陈庆山 《东北农业大学学报》2016,(2):8-15

Micro RNA(mi RNA)是小分子RNA,参与靶基因转录后调控,长度通常为20~22 nt。MIR156基因在植物中分布广,是目前已知第一个与植物年龄有关的小分子RNA,表达量随植物年龄增长而逐渐减少,对植物生长发育起重要调控作用。研究基于古多倍体大豆基因组共线性分析,结合mi RBase收录数据和预测获取的基因,从进化角度对该基因家族进行系统分析。通过对大豆MIR156基因家族成员分布、复制模式、扩张模式和分子系统发育分析,揭示这一古老基因家族基本起源模式。结果表明,该家族由多个祖先基因起源,以全基因组复制及大片段复制等方式发展。研究从方法和结论上对系统分析植物小分子RNA起源和进化具有重要意义。  相似文献   

黑龙江部分大豆品种分子ID的构建   总被引：14，自引：4，他引：14  

高运来  朱荣胜  刘春燕  李文福  蒋洪蔚  李灿东  姚丙晨  胡国华  陈庆山 《作物学报》2009,35(2):211-218

以黑龙江13个育种单位6个积温带的83份大豆品种为材料, 选择分布在大豆基因组19个连锁群的43对SSR引物进行检测, 共检测出等位变异157个, 每个引物检测到的等位变异数变化范围为2~7个, 平均为3.65个。将聚丙烯酰胺凝胶电泳得到的谱带统计结果根据等位变异的片段大小数字化, 用自行编制的ID Analysis 1.0软件进行数据分析。结果表明, 仅需9对引物(Satt100、Sat_218、Satt514、Satt551、Satt380、Satt193、Satt191、Satt442、Sat_084)可将83份参试大豆品种完全区分开。构建了一套黑龙江省大豆品种的分子ID。  相似文献