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为揭示不同生态型油梨间的差异,对4份不同生态型油梨进行全基因组重测序,平均测序深度为26×,平均覆盖度为89.39%。通过与参考基因组比对,4份不同生态型油梨平均杂合率为64.26%。除了西印度群岛生态型油梨品种Donnie的杂合率最低（为35.34%）外,剩下3份油梨品种的杂合率均超过70%。单核苷酸多态位点（SNP）数量为3 854 384～6 290 629个,小片段插入与缺失（Small InDel）总数为1 432 406～1 707 608个,这些突变导致了13 864～18 143个基因的变异。KEGG分析表明,淀粉和蔗糖的代谢通路在4份不同生态型油梨中均存在最多的变异基因。聚类分析表明,相对于西印度群岛生态型,危地马拉和墨西哥生态型油梨品种亲缘关系更近。研究结果在一定程度上反映了不同生态型油梨在基因组水平的差异,为分子标记辅助选择育种提供了科学依据。 相似文献
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【目的】研究小粒咖啡在云南省4个主产区不同坡向的根际土壤理化性质和微生物群落,为改进精品小粒咖啡的可持续生产和管理提供理论依据。【方法】选择云南省4个小粒咖啡主产区（德宏、临沧、普洱和保山）南北坡,测定根际土壤的理化性质;基于根际土壤微生物16S rRNA和ITS序列,解析细菌和真菌群落结构及多样性,并分析根际土壤理化性质对微生物群落的影响。【结果】4个主产区各自南北坡小粒咖啡根际土壤在电导率、水解性氮和速效钾上均存在极显著差异（P<0.01,下同）;有机质在德宏和保山各自南北坡的根际土壤间存在极显著差异;有效磷在德宏、临沧和普洱各自南北坡的根际土壤间存在极显著差异;相对于4个主产区的南坡,根际土壤营养元素更富集于北坡。检测到小粒咖啡根际土壤细菌和真菌群落分别为24和16门,根际土壤细菌优势菌门为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、酸杆菌门（Acidobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）和厚壁菌门（Firmicutes）,真菌优势菌门为子囊菌门（Ascomycota）。4个主产区南北坡间相对丰度具有显著性差异的细菌... 相似文献
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以哥伦比亚热情果种子为试验材料，研究赤霉素浓度（0、200、400、600、800、1 000 mg/L）、浓硫酸浸泡时间（0、0.5、1.0、2.0、5.0、8.0、10.0、15.0 min）、浸泡温度（25、45、65、85、100℃）、25℃无菌蒸馏水浸泡时间（12、24、36、48、60 h）、物理处理方式（不剥壳、机械开口、磨砂和全剥壳）对哥伦比亚热情果种子发芽的影响，以发芽势、发芽率、发芽指数作为考查指标，确定种子发芽适宜条件。结果表明，哥伦比亚热情果种子在赤霉素浓度为800mg/L时，发芽率高达84.44%；浓硫酸最适浸泡时间为5min，发芽率为73.33%;65℃温水浸泡发芽率最高（35.56%）；最适发芽浸泡时间为12 h，发芽率为15.56%;25℃无菌蒸馏水浸泡12 h下，全剥壳的哥伦比亚热情果种子发芽率达47.78%。本研究结果可为哥伦比亚热情果种子育苗及杂交后代种子萌发、性状观察奠定基础。 相似文献
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对3个主栽百香果品种果实、种子形态和果实品质进行检测。结果表明，哥伦比亚热情果在单果质量和果皮重与紫果种百香果和黄果种百香果差异较大。相对于紫果种百香果和黄果种百香果，哥伦比亚热情果种子数较少，但其种子相对较大。果实品质分析结果表明，除还原糖外，可食率、可溶性固形物、VC、可溶性蛋白质和总酸含量在3个主栽百香果品种之间差异显著；3个主栽百香果品种还原糖含量之间相差不多，但哥伦比亚热情果的总酸含量远低于其它2个主栽百香果品种。紫果种百香果和黄果种百香果两个品种口感偏酸，哥伦比亚热情果的口感偏甜，适于直接食用。在未来的哥伦比亚热情果选育中，应重点关注品质性状，增加可溶性固形物、VC和可溶性蛋白质含量。 相似文献
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