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【目的】明确绵羊维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因密码子的使用特征,探究不同物种VDR基因进化规律,为骨代谢等相关疾病动物建模提供参考依据。【方法】利用CodonW、EMBOSS、Usage Codon和DNAMAN等软件对VDR基因CDS区的同义密码子相对使用度(RSCU)、密码子碱基含量、有效密码子数(ENc)及密码子偏好指数(CBI)等参数进行统计分析,并在多物种间进行比较,同时利用ENc-Plot关联分析和中性绘图等方法分析VDR基因密码子偏好性使用的主要影响因素,并基于多物种同义密码子相对使用度数据与系统进化聚类分析探究密码子使用模式与生物进化的内在联系。【结果】绵羊VDR基因中有23个偏好使用以G/C结尾的密码子;大猩猩、鸸鹋、褐家鼠等其他14个物种在密码子使用上表现出了与之较为相似的特征,而在半胱氨酸、甘氨酸、组氨酸、丝氨酸、脯氨酸等个别氨基酸编码时,鸸鹋、褐家鼠和麻雀等部分物种显现出独有特点;ENc-Plot绘图和中性绘图分析显示,选择压力对VDR基因密码子偏好性的影响强于突变压力。【结论】以G/C结尾的密码子为VDR基因优势密码子,自然选择是导致其偏好性的主要力量,密码子偏好使用存在物种特异性,并与物种亲缘关系进化存在关联性。 相似文献
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益生菌EG-2#不同浓度处理对辣椒苗期生长发育的影响研究 总被引:2,自引:0,他引:2
为探讨益生菌EG-2#在辣椒育苗中的应用,以辣椒新组合C1603为材料,研究不同EG-2#浓度(稀释300倍、稀释400倍、稀释500倍)对辣椒苗期生长的影响。结果表明:EG-2#菌液有效改善了辣椒幼苗生长量;300倍EG-2#菌液处理的幼苗与对照相比,植株株高提高了15.9%,茎粗增加7.8%,壮苗指数高37.8%,地上/地下部鲜重分别高21.6%/30.5%,地上/地下部干重分别高23.6%/39.1%。EG-2#在辣椒育苗中应用以喷施300倍液处理对改善辣椒幼苗生长量方面效果最优。 相似文献
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<正>前不久,四川省农作物品种审定委员会组织相关专家,到四川省农科院新都基地,对我所辣椒课题培育的三系配套新组合X1103进行了田间技术鉴定。鉴定专家组在我所辣椒专家宋占锋副研究员的陪同下,首先到田间现场考察了辣椒组合X1103植株性状、果实特征等表现;然后到会议室,听取了项目组就辣椒组合X1103的选育过程的汇报。 相似文献