哈茨木霉菌 (Trichoderma harzianum)和终极腐霉菌 (Pythium ultimum)对玉米蛋白质组的影响(I)(英文)     

《植物病理学报》2004,(4)

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Proteomic analysis of pathogen-responsive proteins from maize stem apoplast triggered by Fusarium verticillioides          下载免费PDF全文

Hafiz ABDUL HASEEB  ZHANG Jun  GUO Yu-shuang  GAO Mei-xu  GUO Wei 《农业科学学报》2022,21(2):446-459

During the attack of a pathogen, a variety of defense-associated proteins are released by the host plant in the apoplast to impede the perceived attack. This study utilized the mass spectrometry (LC-MS/MS) and label-free quantification method to analyze the apoplastic fluid (APF) from maize stalk and identified the proteins responsive to the Fusarium verticillioides infection. We have identified 742 proteins, and among these, 119 proteins were differentially accumulated (DAPs), i.e., 35 up-regulated, 18 down-regulated, and 66 proteins were only induced by the pathogen infection. The differentially accumulated proteins were analyzed for their Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes (KEGG) pathway enrichment. The highly enriched Biological Process (BP) term was the L-serine biosynthesis process, whereas the most enriched Molecular Function (MF) term was the cysteine-type endopeptidase inhibitor activity. It was also found that the pathways related to the biosynthesis of amino acid, biosynthesis of secondary metabolites, protein processing in the endoplasmic reticulum, and carbohydrate metabolic pathways were significantly enriched. Moreover, 61 out of 119 differentially accumulated proteins were predicted as secretory proteins. The secretory pathways analysis showed that a greater number of proteins were secreted through the conventional secretion system compared to the unconventional secretion system. The identified secreted proteins were related to a variety of pathways in defense responses including cell redox homeostasis, cell wall modification, signal transduction, carbohydrate metabolism, binding proteins (metal ion binding, RNA binding and heme-binding), maintenance and stabilization of other proteins, indicating a complex response from the plant to the fungal infection. Our data suggested that a number of host proteins belonging to various pathways have been modulated in the apoplastic region.  相似文献   

蛋白质组学在番茄非生物逆境胁迫中的研究进展     

王强  王柏柯  刘会芳  韩宏伟  庄红梅  王娟  杨涛  王浩  秦勇 《新疆农业科学》2021,58(10):1829-1837

【目的】回顾近年来蛋白质组学在番茄逆境胁迫中的研究进展,综述蛋白质组学技术在番茄响应非生物(盐碱、干旱、高温、低温、其它)胁迫上的研究进展,为利用蛋白质组学技术进一步研究番茄响应非生物逆境胁迫的分子机制奠定理论基础。【方法】运用统计学方法收集文献资料,并分析汇总蛋白质组学技术在番茄响应非生物(盐碱、干旱、高温、低温等)胁迫的研究文献进展情况。【结果】盐胁迫耐受性(渗透调节,渗透保护,离子稳态,消除氧清除剂,胁迫反应等)与胁迫的持续时间有关;下调的蛋白主要参与代谢和能量转换,上调的蛋白参与信号转导或运输;干旱应答蛋白包括与耐热性和渗透性保护剂的产生、脂质代谢、细胞壁修饰、神经酰胺代谢和丝裂原活化蛋白磷酸化相关的蛋白;蛋白质广泛参与了细胞过程,包括防御/应激反应,离子结合/转运,光合作用和蛋白质合成;最初如何感知胁迫条件,以及植物器官激活了哪些主要反应,可以避免低温胁迫晚期相关蛋白的干扰。【结论】在非生物逆境胁迫条件下,番茄通过改变自身的蛋白质表达水平对各种非生物胁迫作出响应。蛋白质组学研究能够全面揭示番茄响应胁迫时其细胞内蛋白质的动态变化规律,鉴定差异表达的蛋白质,是番茄抗逆生物学研究的重要组成部分。  相似文献   

不同环境温度条件下双峰驼血浆蛋白质组学差异     

刘姗姗  ;陶金忠  ;武小虎  ;魏玉兵  ;童建伟  ;胡俊杰  ;张勇  ;赵国顺  ;赵兴绪 《兽医大学学报》2014,(11):1824-1828

根据不同环境温度条件下双峰驼血浆中蛋白表达的差异,探讨环境高温对双峰驼的差异蛋白在环境适应性中的作用机制。采用二维凝胶电泳（2-DE）结合MADIL-TOF-TOF串联质谱的方法对环境高温双峰驼的血浆进行蛋白质组分析鉴定。结果显示,4种蛋白的表达上调,分别是免疫球蛋白重链的恒定区,结合珠蛋白,载脂蛋白AIV,纤维蛋白原β链前体。1种蛋白的表达下调即血清白蛋白。结果表明,环境高温引起内分泌系统变化,从而使一些蛋白的表达发生变化。这些蛋白主要与机体急性期应答、免疫反应、物质运输及物质代谢等相关。  相似文献   

油棕胚蛋白质组学研究体系的建立     

王永  李静  吴翼  张大鹏  雷新涛 《广东农业科学》2014,41(22):126-129

油棕通过商业化种子繁殖,但种子萌发机理尚不明确,胚蛋白质组学研究有助于快速定位其关键调控因子.建立了油棕胚蛋白质学研究体系,涵盖种胚样品收集、总蛋白质提取、双向电泳体系及下游质谱鉴定数据分析,研究体系相对完整,对于促进基于蛋白质组学的油棕种子萌发机理研究及分子辅助育种研究等后续相关研究提供基础.  相似文献   

北海道黄杨叶片应答低温胁迫的蛋白质组分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

郝强  张睿鹂  冷平生  关雪莲 《园艺学报》2011,38(11):2169-2179

 采用双向电泳的蛋白质组学方法分析了北海道黄杨叶片蛋白质对低温胁迫的应答反应。北海道黄杨植株在室外种植，从2008年10月—2009年2月每月提取叶片总蛋白。在考马斯亮蓝染色的2-DE胶上发现36个表达量显著差异蛋白点，其中通过质谱鉴定出19个蛋白质，包括已知的和新鉴定的低温胁迫相关蛋白质。这些鉴定出的蛋白质涉及多个生理过程，如能量与代谢、调控、防御应答等，同时这些蛋白质的表达模式与生理生化变化模式相一致。  相似文献   

小麦V-CMS和杂种F1代线粒体蛋白质组表达差异     

郭宝健  李鹏  牟秋焕  刘保申 《分子植物育种》2011,9(3):302-308

本研究以V型小麦恢复基因的近等基因系为基础材料,运用蛋白质组学技术对V-CMS及杂种F1黄化苗和幼穗时期线粒体蛋白质表达图谱进行了比较,分析了差异蛋白质点与CMS的关系.主要结果如下:(1)比较了黄化苗和幼穗线粒体蛋白质的表达图谱,鉴定了10个差异表达的蛋白质点,包括与能量代谢有关的F0-F1ATP酶复合物的亚基和一些...  相似文献   

应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析草菇同核和异核菌丝蛋白质组   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘靖宇  江玉姬  谢宝贵  陈炳智  廖伟  邓优锦  刘朋虎 《食用菌学报》2012,19(1):1-12,105

首次利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合二维液相色谱串联质谱对草菇(Volvariella volvacea)同核和异核菌丝蛋白质组进行研究。采用QExactive质谱鉴定并经MASCOT软件搜库,对所有鉴定蛋白进行主成分分析(principal component analysis,PCA)、层次聚类(hierarchical clustering)分析和GO(gene ontology)注释,并进行生物信息学分析。结果共获得2335个不同肽段,鉴定到1039个蛋白,其中1030个蛋白具有定量信息。在同核菌丝中显著上调蛋白83个,下调蛋白97个,表明iTRAQ标记技术结合二维液相色谱串联质谱可有效地分离和鉴定草菇菌丝蛋白质组。该研究结果为更深入全面地研究草菇菌丝蛋白质组学奠定基础。  相似文献   

健康奶牛与临床型乳腺炎奶牛乳腺线粒体蛋白组差异表达分析     

王建锋  陶金忠  张勇  赵兴绪 《中国兽医学报》2012,32(1):63-68

运用亚细胞蛋白质组学的研究策略,分离纯化亚细胞结构再进行蛋白质组学研究,可提高低丰度蛋白在双向凝胶电泳中的检出率。通过对比分析乳腺炎奶牛乳腺与正常奶牛乳腺线粒体蛋白质组的表达变化,为奶牛乳腺炎的生物学治疗及抗病育种工作筛选出目基因和蛋白。超速离心法分离线粒体,双向凝胶电泳分离蛋白,PDQuest7．4软件分析差异蛋白斑点,高效液相色谱串联离子阱质谱鉴定差异蛋白。从奶牛乳腺线粒体蛋白2-DE图谱中筛选出17个差异表达的蛋白质斑点,质谱鉴定出17个差异表达蛋白（6个蛋白在奶牛乳腺炎发生过程中下调,8个上调,1个只在正常情况下表达,2个只在乳腺炎乳腺组织中表达）。筛选出的差异蛋白质涉及到细胞的能量代谢、蛋白质合成、mRNA的加工成熟及调亡调控等许多方面,表明奶牛乳腺炎发生时乳腺线粒体组织结构和代谢状态都发生了明显的变化。  相似文献   

光系统Ⅱ抑制型除草剂Atrazine诱导小麦幼苗叶绿体蛋白质组变化分析     

王振英  李学平  李雪梅  彭永康 《农业环境保护》2010,(6):1039-1043

为了研究除草剂作用机理,用光系统Ⅱ抑制型除草剂阿特拉津（Atrazine）处理小麦幼苗,用2-DE技术和生物质谱方法,分析了叶绿体蛋白质组的变化。结果发现,在10mg·L-1浓度处理时,有7个叶绿体蛋白质斑点（斑点1,50kDa/PI8.1;斑点2,41kDa/PI8.4;斑点3,41kDa/PI7.6;斑点4,23kDa/PI7.1;斑点5,31kDa/PI5.0;斑点6,35kDa/PI8.9;斑点7,14kDa/PI8.1）丢失。对7个发生变化的斑点利用MALDI-MS方法,于NCBI进行数据查询,其中,有6个叶绿体蛋白质归属得到鉴别,它们是Calvin循环中,固定CO2的RuBPcase的激活酶（2个同工体和1个β型前体）,在H2O氧化裂解中起重要作用的23kDa氧释放蛋白（psbp protein）,在能量转贮中起重要作用的3-磷酸甘油酸激酶和催化HCO3--CO2水合作用可逆反应的碳酸酐酶。研究表明,叶绿体蛋白质组中丢失的6个蛋白质是Atrazine处理的相关蛋白。  相似文献