原核生物基因组三核苷酸转移概率偏倚的物种特异性及致病关联性     

章芬  黄庆生  严翠婷  吴建华 《广西农业生物科学》2012,(3):205-211

作为DNA序列的重要组成特征,基因组寡核苷酸使用模式及其偏倚的研究已被广泛应用于原核生物基因组的分析.然而,关于寡核苷酸使用模式的偏倚是否具有种群特异性并反映种群的功能这一问题,尚未阐明.我们基于一阶马尔可夫链模型,提出了一个度量寡核苷酸使用模式偏倚的新指标--基因组三核苷酸（trinucleotide;tri-）转移概率偏倚（transition probability bias;TPB）特征向量,或称之为三核苷酸转移概率最大偏倚分布,并分析比较了727条有代表性的原核生物基因组序列tri-TPB特征向量.结果表明,基因组tri-TPB特征向量具有物种特异性,亲缘关系越近的物种,它们的tri-TPB特征向量越相似;同种内的不同菌株具有几乎完全相同的tri-TPB特征向量,并且不依赖于基因组的GC含量;此外,基因组tri-TPB特征向量的相似性与菌株的致病性特征相关.本研究结果为基于全基因组寡核苷酸组成和分布信息的物种及其致病性进化分析提供了新的思路和方法.  相似文献   

花生青枯菌红安分离物的鉴定   总被引：4，自引：0，他引：4  

晏立英  黄家权  雷永  王圣玉  廖伯寿 《中国油料作物学报》2010,32(1):144

从湖北红安发病花生根部分离到一个细菌分离物2C1,对该分离物进行了TZC显色反应,致病力的测定,16s rRNA、23s rRNA和鞭毛蛋白基因filc的PCR扩增,16s rRNA PCR扩增产物的序列分析。结果显示,分离物2C1在TZC培养基上表现出青枯菌的典型菌落形态,对花生具有强致病性,PCR扩增获得与预期大小的产物片段; 16s rRNA核苷酸序列具有与其它青枯菌分离物99%左右的一致性。上述结果表明：2C1是具有强致病力的花生青枯菌分离物。  相似文献   

水稻品种空育131的稻瘟菌致病菌株的遗传多样性分析     

罗生香  王倩  张帆  纪明山  周永力 《作物杂志》2013,(4)

采用AFLP(Amplified fragment length polymorphism)技术初步分析了采自黑龙江省稻田49个稻瘟病菌的遗传多样性.这些菌株在0.68的相似水平上被划分为6个宗谱,宗谱G1和G3为优势宗谱,均含有17个菌株,各自占菌株总数的35.1％.在0.90相似水平上被划分为48个宗谱,显示丰富的遗传多样性.人工接种结果表明多数稻瘟病菌株具有强或较强致病力,占69.23％.上述结果为了解黑龙江省稻瘟病菌群体结构特征及水稻抗稻瘟病育种提供信息.  相似文献   

布氏艾美耳球虫早熟弱毒虫株的选育   总被引：4，自引：0，他引：4  

胡景辉  邹仁明  乔美花  汪明  蒋金书 《畜牧兽医学报》1999,30(1):86-90

运用Ｊｅｆｆｅｒｓ（１９７５）选育法进行了Ｅ．ｂｒｕｎｅｔｔｉ早熟弱毒虫的选育,经过连续七代的选育,获得了Ｅｉｍｅｒｉａｂｒｕｎｅｔｔｉ早熟弱毒虫株,该虫株的潜隐期为１０８ｈ,比Ｅ．ｂｒｕｎｅｔｔｉ亲本毒株提前了１２ｈ以上。  相似文献