紫花槭秋季叶色表达转录组初步分析     

张佳奇  赵东辉  高玉福  荣立苹  李佳霖  翁卓 《分子植物育种》2021,19(21):7075-7083

为了丰富紫花槭转录组数据,进一步开展紫花槭秋季叶片呈色机制研究.本研究以紫花槭秋季转色期三个阶段(前期,中期,后期)叶片为材料,采用高通量测序技术进行转录组初步分析.转录组数据共获得50501条Unigene,有35316条Unigene在数据库中得到注释,其中NR数据库中注释到的Unigene数量最多,共35024条,占69.4％.在注释到的物种中,紫花槭比对的Unigene与甜橙(Citrus sinensis)相似度最高,共有4290条,占12.25％.紫花槭转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类,共有25375条,其中生物学过程的基因最多,主要聚集于代谢过程和细胞过程等.基于Unigene库的基因结构分析,其中SSR分析共获得12711个SSR标记,占Unigene总数的36％.SSR位点共包含150种重复基元,单碱基重复所占比例最高(7184个,61.86％),四碱基重复、五碱基重复和六碱基重复所占比例较低.Unigene库中共有328239个SNP位点,发生频率为1/190 bp,SNP位点分为转换和颠换两种类型的碱基替换方式,其中碱基转换位点213787个(65.13％),碱基颠换位点114452个(34.87％),碱基转换类型发生频率高于颠换类型.6种单碱基变异中,2种转换类型A/G、C/T的发生频率分别为33.03％和32.10％;4种颠换类型中A/T发生频率最高,为11.52％;C/G发生频率最低,为5.79％.紫花槭转录组秋季叶色表达的转录组分析,可为紫花槭叶色基因调控、定向分子育种和培育彩叶新品种提供研究提供基础的数据信息.  相似文献   

功能基因组学研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

苗向阳  刘海涛 《中国畜牧兽医》2004,31(6):29-32

基因组研究计划包括以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学2方面的内容.作者对功能基因组的主要研究方法:微阵列或DNA芯片、表达序列标签法、基因表达系列分析法、蛋白质组学分析法以及反向遗传学技术等进行了简要介绍,同时综述了上述各种技术的优缺点以及部分生物功能基因组的研究进展.  相似文献   

促卵泡生成素受体基因的SNP对牛双胎性状的标记研究   总被引：5，自引：0，他引：5  

雷雪芹  陈宏  袁志发  雷初朝  徐廷生  孙维斌 《云南畜牧兽医》2002,(4):28-29

以秦川牛和荷斯坦奶牛的双胎母牛和单胎母牛为实验材料，以牛的FSHR基因的第10个外显子作为标记牛双胎性状的候选基因，用SNP法进行了多态检测。结果发现，在秦川牛的双胎母牛中突变率为60％（6／10），而在单胎母牛中突变率为20％（2／10）；在荷斯坦奶牛中，双胎母牛突变率为31.25％（5／16），单胎母牛突变率为6.67％（1／15）；由此可见双胎牛和单胎牛二者之间FSHR基因的第10个外显子的突变率差异明显。这表明选择FSHR基因的10个外显子有可能作为双胎性状的候选基因。经序列分析发现在FSHR基因的第1506个碱基发生了突变（T→C），但氨基酸没有发生变化。  相似文献   

基因组特异性引物扩增细菌转录产物标记后用于DNA芯片分析     

张亚菲  王秀荣等 《预防兽医学进展》2001,3(3):9-11

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分子生物学新技术—生物芯片     

陈汉忠 《预防兽医学进展》2001,3(2):20-21

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宠物犬肩膀打进"身份证"--身体内植入芯片存入十多项重要信息可免除司法纠纷     

《中国工作犬业》2005,(11):58-58

如果爱犬不慎走失，您用什么证明这是您的爱犬呢？一旦爱犬有了“身份证”，这个难题迎忍而解。这个身份证比较特殊，是用芯片植入器将米粒大小的芯片植入爱犬肩膀，通过扫描器，这头犬的重要信息即刻显示。  相似文献   

生物芯片在疾病诊断中的应用     

石锐  孙凯  王秀荣  陈维多 《畜牧兽医科技信息》2005,(3):23-24

生物芯片技术是20世纪90年代发展起来的分子生物学技术。自1991年，f硐or等提出DNA芯片的概念后，以DNA芯片为代表的生物芯片(Biochip)技术得到了迅猛发展。当然，生物芯片从实验室走向工业化却直接得益于探针固相原位合成技术和照相平板印刷技术的有机结合，以及激光共聚焦显微技术的引入。目前生物芯片技术已应用于分子生物学，疾病的预防、诊断和治疗，DNA序列测定，新药开发，生物武器的研制，司法鉴定，环境污染监测和食品卫生监督等诸多领域。  相似文献   

遗传标记及其在家禽育种中的应用   总被引：1，自引：1，他引：1  

M.G.Emara  H.Kim  吴艳 《中国家禽》2005,27(7):41-42

1 SNP SNP是染色体中遗传变异的最普通形式,如在人体已经检测基因组DNA中每1,000到2,000个单位有1个SNP,在某些区域估计每300个单位有一个SNP.基于SNP的高分辨率,遗传图谱在一些人的染色体上通常没有得到发展.正如其名称所指,SNP是发生在基因(启动子、外显子、或内含子)或基因之间(基因间隔区)的单个碱基改变或核苷酸变异.编码序列中的SNP以同义(不会导致氨基酸改变)或非同义(导致氨基酸改变)来分类.非同义SNP由于对蛋白质表达及最终对表现型的潜在影响而受到重视.相反,同义SNP可能对基因表达有微小的影响(除那些在启动子和其它基因组区域中,对DNA-蛋白质作重要的核苷酸或与RNA稳定性有关的核苷酸).同义和非同义SNP在基因图谱研究中均是很好的遗传标记.  相似文献   

6种人兽共患病病原核酸液相芯片检测体系的建立     

王艳  沈家红  蒋蔚  张磊萍  张强  林颖峥  熊炜  李树清 《中国动物检疫》2018,35(12):80-84

本研究通过设计、合成特异性引物和探针并对其进行修饰,将探针和特定荧光编码微球共价交联后,利用Luminex检测仪读取荧光信号,从而建立了针对布鲁氏菌、沙门氏菌、弓形虫,狂犬病病毒、巴氏通体、弯曲杆菌等6种病原的液相芯片检测方法。数据显示,本研究建立的液相芯片检测体系具有良好的特异性,检测灵敏度达50拷贝数,能同时检测6种重要人兽共患病病原,对于这6种人兽共患病的快速筛查和控制提供了技术支撑。  相似文献   

用生物合成的长链开环探针进行SNP分型     

赵松子  沈向群 《江苏农业学报》2011,27(1):52-56

由于化学合成长链开环探针面临许多困难,因此需要开发一种长链开环探针的生物合成方法.该研究利用生物合成的146 bp长链开环探针进行单核苷酸多态性(SNP)分型,以验证长链开环探针生物合成的可行性.结果表明:长链开环探针能够特异地与目的DNA结合,完美配对的长链开环探针能够被DNA连接酶连接,形成环状单链DNA分子,不能...  相似文献