鸡白痢沙门氏菌感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响 |
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引用本文: | 白潜,陈远红,陈曦,江康峰,叶玮琪,向斌,杨亮宇,杨静.鸡白痢沙门氏菌感染对雏鸡脾脏miRNA表达谱的影响[J].云南农业大学学报,2023(2):220-227. |
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作者姓名: | 白潜 陈远红 陈曦 江康峰 叶玮琪 向斌 杨亮宇 杨静 |
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作者单位: | 云南农业大学动物医学院 |
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基金项目: | 国家蛋鸡产业技术体系(CARS-40-S25); |
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摘 要: | 【目的】鉴定感染鸡白痢沙门氏菌后雏鸡脾脏差异表达的miRNA,为阐明miRNA在鸡白痢沙门氏菌感染中的调控机制提供理论基础。【方法】采集感染和未感染鸡白痢沙门氏菌的SPF雏鸡脾脏,提取脾脏RNA,构建6个miRNA文库;利用Illumina Hiseq 2500测序技术和生物信息学分析筛选差异表达miRNA,通过TargetScan和miRanda算法预测差异表达miRNA的靶基因,并进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,最后利用RT-qPCR方法验证测序结果。【结果】鉴定到29个差异表达miRNAs,其中15个显著上调、14个显著下调。GO分析表明:脂多糖介导的信号通路正调控以及NIK/NF-κB介导的信号通路负调控等免疫相关生物学过程显著富集;KEGG分析显示:差异表达的miRNA主要参与溶酶体和内吞作用等免疫相关通路。高通量测序结果与RT-qPCR结果一致。【结论】成功鉴定到鸡白痢沙门氏菌感染雏鸡脾脏miRNA表达谱,获得29个鸡白痢沙门氏菌感染潜在相关miRNAs。
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关 键 词: | 鸡白痢沙门氏菌 SPF雏鸡 脾脏 差异表达miRNA 免疫 |
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