| 希金斯炭疽菌中5个典型Septin的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 韩长志.希金斯炭疽菌中5个典型Septin的生物信息学分析[J].河南农业科学,2014,43(8). |
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| 作者姓名： | 韩长志 |
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| 作者单位： | 西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明,650224 |
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| 基金项目： | 云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金项目，云南省重点学科森林保护学科研项目 |
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| 摘 要： | 希金斯炭疽菌可以侵染菜心、萝卜等众多十字花科蔬菜引起炭疽病,给农业生产造成巨大的经济损失.septin是一个广泛存在于除植物以外其他生物的基因家族,其功能与细胞分裂、细胞内物质运输以及细胞周期的调控与细胞凋亡等关系密切,将成为新开发药物的潜在靶标.基于酿酒酵母中7个典型Septin蛋白的氨基酸序列,对炭疽菌属蛋白质数据库进行Blastp比对和关键词搜索,并通过SMART在线分析最终明确希金斯炭疽菌中含有5个典型的Septin.同时,从理化性质、跨膜区结构、二级结构以及亚细胞定位等方面对Septin进行生物信息学分析,结果显示,上述Septin均为亲水性蛋白,且不具有跨膜结构,其二级结构及亚细胞定位情况不同.
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| 关 键 词： | 希金斯炭疽菌 Septin蛋白 生物信息学分析 理化性质 亚细胞定位 二级结构 |
Bioinformatics Analysis of Five Typical Septin Sequences in Colletotrichum higginsianum |
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| HAN Chang-zhi.Bioinformatics Analysis of Five Typical Septin Sequences in Colletotrichum higginsianum[J].Journal of Henan Agricultural Sciences,2014,43(8). |
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| Authors: | HAN Chang-zhi |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Colletotrichum higginsanum Septin bioinformatics analysis physicochemical properties sub-cellular localization secondary structure |
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