江泉黑猪GPAT3基因多态性及其与生长性状的关联分析 |
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引用本文: | 刘汇鑫,王文文,许飞,马小燕,李晓敏,唐辉.江泉黑猪GPAT3基因多态性及其与生长性状的关联分析[J].中国畜牧兽医,2024(4):1549-1560. |
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作者姓名: | 刘汇鑫 王文文 许飞 马小燕 李晓敏 唐辉 |
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作者单位: | 山东农业大学动物科技学院,山东省动物生物工程与疫病防治重点实验室,农业农村部非粮饲料资源高效利用重点实验室(部省共建) |
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基金项目: | 山东省农业良种工程项目(2020LZGC012);;“十四五”国家重点研发计划(2021YFD1301203); |
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摘 要: | 【目的】探究江泉黑猪甘油-3-磷酸酰基转移酶3(glycerol-3-phosphate acyltransferase 3,GPAT3)基因多态性及其与生长性状的相关性,为江泉黑猪的遗传改良和优化繁殖计划提供理论和技术支持。【方法】采集292头江泉黑猪的耳组织样并提取DNA,PCR扩增GPAT3基因片段,结合Sanger测序与MassARRAY?核酸质谱分析系统检测单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及基因分型。利用R语言3.6.2、HaploView、PHASE等软件进行GPAT3基因SNP位点的遗传效应、连锁不平衡和单倍型分析。利用SAS 9.2软件分析GPAT3基因SNP位点及其构成的单倍型块与江泉黑猪生长性状的相关性。【结果】在GPAT3基因及其5′-调控区共发现10个SNPs,其中4个为低度多态,6个为中度多态;7个SNPs位点基因型频率分布处于哈代-温伯格平衡状态。关联分析发现,9个SNPs与江泉黑猪生长性状呈显著关联(P<0.05),其中g.134957929 G>A、g.1349...
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关 键 词: | 江泉黑猪 GPAT3基因 单核苷酸多态性 生长性状 |
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