白来航鸡STING基因克隆、生物信息学及组织表达特性分析 |
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引用本文: | 王艳,张颖,赵雅妮,易林,史珍,周长明,周宛蓉,姜莉莉,樊兆斌.白来航鸡STING基因克隆、生物信息学及组织表达特性分析[J].中国畜牧兽医,2024(4):1372-1381. |
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作者姓名: | 王艳 张颖 赵雅妮 易林 史珍 周长明 周宛蓉 姜莉莉 樊兆斌 |
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作者单位: | 菏泽学院药学院 |
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基金项目: | 山东省自然科学基金项目(ZR2019MC036、ZR2023QC302); |
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摘 要: | 【目的】克隆白来航鸡干扰素基因刺激因子基因(stimulator of interferon genes, STING)CDS区序列并进行生物信息学和组织表达分析,为阐明STING基因在抗病毒免疫应答中的作用奠定基础。【方法】采用PCR扩增并克隆白来航鸡STING基因CDS区,测序后对其编码氨基酸序列进行相似性比对及系统进化树构建,利用生物信息学预测STING蛋白的理化特性及结构功能,并利用实时荧光定量PCR技术检测STING基因在鸡心脏、肝脏等14个组织中的表达情况。【结果】白来航鸡STING基因CDS区序列全长1 140 bp,编码379个氨基酸。相似性比对和系统进化树分析结果表明,白来航鸡STING基因与原鸡的相似性最高(99.7%),亲缘关系最近,与冠小嘴乌鸦亲缘关系最远。STING蛋白为酸性、亲水性蛋白,分子质量为42.625 ku,等电点(pI)为6.67,不稳定系数为69.26,脂肪系数为105.01。该蛋白大部分在线粒体和内质网上合成,含有跨膜结构,不含信号肽。STING蛋白二级结构包括α-螺旋(54.62%)、延伸链(10.29%)、β-转角(3.43%)及无规则卷曲...
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关 键 词: | 白来航鸡 STING基因 克隆 生物信息学 表达 |
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