| 米氏凯伦藻18S rDNA和转录间隔区序列分析 |
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| 引用本文： | 郑俊斌,张凤英,马凌波,陆亚男.米氏凯伦藻18S rDNA和转录间隔区序列分析[J].上海水产大学学报,2009,18(6). |
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| 作者姓名： | 郑俊斌 张凤英 马凌波 陆亚男 |
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| 作者单位： | 郑俊斌,ZHENG Jun-bin(中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海,200090;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306);张凤英,马凌波,陆亚男,ZHANG Feng-ying,MA Ling-bo,LU Ya-nan(中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室,上海,200090) |
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| 基金项目： | 上海市科学技术委员会科研计划项目，中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院东海水产研究所)资助项目 |
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| 摘 要： | 对赤潮多发藻米氏凯伦藻(Karenia mikimotoi)核糖体18S rDNA及其转录间隔(ITS) 区序列PCR扩增并测序,获得18S rDNA和ITS基因序列长度分别为1 690 bp和654 bp.结合12种甲藻和1种硅藻作序列比较分析,分别在ITS1、ITS2序列寻找到适宜设计特异性引物探针区域,并用邻接法构建系统进化树,研究各藻种间亲缘关系.遗传距离分析结果显示米氏凯伦藻与短凯伦藻(Karena brevis)、微小卡罗藻(Karlodinium micrum )等分类学上较近的藻种18S rDNA序列相似度为97%～99%,远大于微小原甲藻(Prorocentrum minimum)、海洋原甲藻(P.micans)、塔玛亚历山大藻(Alexandrium tamarense)等在分类学上相距较远的藻种,各藻种间的ITS序列平均相似度明显低于18S rDNA序列.以18S rDNA与ITS序列构建的进化树拓扑结构相一致,18S rDNA序列相对保守,适合进行属以上关系的系统进化分析,而ITS序列变异较大,适合种属间鉴别分析,且ITS1和ITS2是变异很大的区域,适合种间的分子特异性鉴定,这为快速鉴别赤潮多发藻米氏凯伦藻提供了依据,进而为治理赤潮提供帮助.
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| 关 键 词： | 米氏凯伦藻 核糖体18SrDNA 转录间隔区 系统进化 分子鉴定 |
Sequence analysis of Karenia mikimotoi based on ribosomal 18S rDNA and internal transcribed space regions |
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| ZHENG Jun-bin,ZHANG Feng-ying,MA Ling-bo,LU Ya-nan.Sequence analysis of Karenia mikimotoi based on ribosomal 18S rDNA and internal transcribed space regions[J].Journal of Shanghai Fisheries University,2009,18(6). |
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| Authors: | ZHENG Jun-bin ZHANG Feng-ying MA Ling-bo LU Ya-nan |
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