Asia1型口蹄疫病毒基因组的测序分析 |
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引用本文: | 王琳萱,陈思敏,张印红,孙东杰.Asia1型口蹄疫病毒基因组的测序分析[J].浙江农业学报,2014(2). |
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作者姓名: | 王琳萱 陈思敏 张印红 孙东杰 |
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作者单位: | 兰州大学公共卫生学院营养与食品卫生研究所;中国农业科学院兰州兽医研究所/家畜疫病病原生物学国家重点实验室; |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项基金项目(1610322013023) |
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摘 要: | 对中国口蹄疫病毒Asia1/JS/2005毒株的全基因组进行了分段扩增并测序。结果表明,该毒株的基因组全长为8 174 nt,其中5’UTR为1 092 nt;ORF为6 990 nt;3’UTR为92 nt。利用DNAstar软件对该毒株和Asia1型其他24毒株基因组序列进行同源性分析表明,该毒株的非结构蛋白和5’UTR比较保守。研究还发现了可能与生物学功能相关的新的保守和变异区域。系统树分析表明Asia1/JS/2005,Asia1/1/YZ/2006,Asia1/WHN/2006,Asia1/HN/2006和Asia1/YS/2005属于同一分支,表明这些毒株间有着紧密的遗传关系,其中与其亲缘关系最为密切的是Asia1/YS/2005。
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关 键 词: | 口蹄疫病毒 Asia/JS/ 基因组 |
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