| 普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析 |
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| 引用本文： | 林萍,姚小华,曹永庆,龙伟,王开良,滕建华.普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析[J].林业科学研究,2013,26(6):744-751. |
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| 作者姓名： | 林萍 姚小华 曹永庆 龙伟 王开良 滕建华 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400;中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400;中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400;中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400;中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400;浙江省金华市东方红林场, 浙江 金华 321025 |
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| 基金项目： | 国家林业公益性行业科研专项“林改后南方林地可持续高效经营关键技术研究与集成示范”（201004008）；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目“油茶品种分子鉴别系统构建及油茶基因芯片开发”（RISF6804） |
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| 摘 要： | 泛素结合酶（E2）是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一，在靶蛋白识别、与泛素连接酶（E3）互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列，命名为 UBE2-J2， 该基因编码239AA，与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性；同源建模的结果表明：普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点（UBCc），第8~122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域，第75~122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基，其中，87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点，另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2-J2具有C端延伸结构，故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员。
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| 关 键 词： | 普通油茶 泛素结合酶 Solexa测序 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2012/9/26 0:00:00 |
Characterization of a Novel Ubiquitin-conjugating Enzyme from Camellia oleifera |
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| LIN Ping,YAO Xiao-hu,CAO Yong-qing,LONG Wei,WANG Kai-liang and TENG Jian-hua.Characterization of a Novel Ubiquitin-conjugating Enzyme from Camellia oleifera[J].Forest Research,2013,26(6):744-751. |
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| Authors: | LIN Ping YAO Xiao-hu CAO Yong-qing LONG Wei WANG Kai-liang and TENG Jian-hua |
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| Institution: | Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;Dongfanghong Forest Farm of Jinhua City, Zhejiang Province, Jinhua 321025, Zhejiang, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Camellia oleifera ubiquitin-conjugating enzyme (E2) Solexa sequencing bioinformatics |
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