| 基于DNA条形码技术对镰刀菌属的检测鉴定 |
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| 引用本文： | 雷娅红,况卫刚,郑春生,李秀璋,高文娜,李春杰.基于DNA条形码技术对镰刀菌属的检测鉴定[J].植物保护学报,2016,43(4):544-551. |
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| 作者姓名： | 雷娅红 况卫刚 郑春生 李秀璋 高文娜 李春杰 |
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| 作者单位： | 1. 兰州大学草地农业科技学院,草地农业生态系统国家重点实验室,兰州730020;2. 中国农业大学植物保护学院,北京,100193;3. 北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心,北京,101312 |
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| 基金项目： | 国家质量监督检验检疫总局科技计划项目（2014IK005，2015IK225），国家质量监督检验检疫总局公益性课题（201310068） |
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| 摘 要： | 为筛选合适的基因序列对镰刀菌属Fusarium真菌进行检测鉴定,以从不同寄主分离获得的11种57株镰刀菌为材料,选择nr DNA-ITS、EF-1α、mt SSU和β-tubulin作为候选基因,将序列获得的难易程度和种内与种间遗传距离频率分布作为评价指标,对测序获得的有效序列进行研究,筛选出该属的DNA条形码。结果表明:EF-1α基因具有较高的PCR扩增与测序成功率,为98.2%,较mt SSU和β-tubulin基因更容易获得序列片段;且种内与种间遗传距离重叠部分较少,除木贼镰刀菌F.equiseti种内遗传距离为0.029,大于黄色镰刀菌F.culmorum和禾谷镰刀菌F.graminearum种间遗传距离0.021外,种间差异明显大于种内差异,优于其它基因,能更好地区分镰刀菌;利用EF-1α基因序列构建的系统发育树显示,相同种聚集在同一分支,不同种划分在不同分支,鉴别能力较好;EF-1α基因不能扩增出其它6株非镰刀菌属的主要植物病原真菌,而对镰刀菌的PCR扩增效果很好,电泳检测结果条带单一、明亮。表明EF-1α基因可作为镰刀菌属鉴定的DNA条形码。
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| 关 键 词： | 镰刀菌 序列分析 PCR扩增与测序成功率 遗传距离 DNA条形码 |
| 收稿时间： | 2015/5/12 0:00:00 |
Detection and identification of the genus Fusarium by DNA barcoding |
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| Lei Yahong,Kuang Weigang,Zheng Chunsheng,Li Xiuzhang,Gao Wenna and Li Chunjie.Detection and identification of the genus Fusarium by DNA barcoding[J].Acta Phytophylacica Sinica,2016,43(4):544-551. |
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| Authors: | Lei Yahong Kuang Weigang Zheng Chunsheng Li Xiuzhang Gao Wenna and Li Chunjie |
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| Institution: | Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystems, College of Pastoral Agricultural Science and Technology, Lanzhou University, Lanzhou 730020, Gansu Province, China,College of Plant Protection, China Agricultural University, Beijing 100193, China,Beijing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Beijing 101312, China,Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystems, College of Pastoral Agricultural Science and Technology, Lanzhou University, Lanzhou 730020, Gansu Province, China,Beijing Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Beijing 101312, China and Key Laboratory of Grassland Agro-Ecosystems, College of Pastoral Agricultural Science and Technology, Lanzhou University, Lanzhou 730020, Gansu Province, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Fusarium sequence analysis PCR and sequencing success rate genetic distance DNA barcoding |
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